RNA–Protein interactions for RNA: YML011C

RAD33, Transcript of Protein involved in nucleotide excision repair, yeast

Gene RAD33, Length 534 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD33	YML011C	TPP1	Q03796	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	DAL4	Q04895	635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	CDA2	Q06703	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	REV3	P14284	1504 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	VPS35	P34110	944 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	GTS1	P40956	396 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	XKS1	P42826	600 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	RSM26	P47141	266 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	ULP1	Q02724	621 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	TOS4	Q06266	489 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	MET4	P32389	672 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	DAK2	P43550	591 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	YNR063W	P53749	607 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	SQT1	P35184	431 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	PPX1	P38698	397 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	SAM35	P14693	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	HSE1	P38753	452 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	PEX28	P38848	579 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	LAP2	Q10740	671 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	WHI5	Q12416	295 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	UFD4	P33202	1483 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAD33	YML011C	ATG14	P38270	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YHL012W	P38709	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	THI12	P42883	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	THI5	P43534	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	THI11	P47183	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	THI13	Q07748	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	OXR1	Q08952	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RAD33	YML011C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	THI80	P35202	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	RDH54	P38086	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	ADI1	Q03677	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SSK2	P53599	1579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SIN3	P22579	1536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	STU1	P38198	1513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YCR015C	P25616	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	ADD66	P36040	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	FAA3	P39002	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YJL045W	P47052	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	MRPL22	P53881	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	ESC8	Q08119	714 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YTA7	P40340	1379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	MDL2	P33311	773 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YKL222C	P35995	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	TAF1	P46677	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	AIM26	P32858	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	RKM2	Q03942	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	BPT1	P14772	1559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	IPL1	P38991	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	PIC2	P40035	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	VPS53	P47061	822 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	EST2	Q06163	884 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	POL1	P13382	1468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	YSC84	P32793	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	SPP41	P38904	1435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD33	YML011C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RAD33	YML011C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	SSM4	P40318	1319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	AFG2	P32794	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	GIP4	P39732	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	RSC58	Q07979	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	KIP1	P28742	1111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	SEC20	P28791	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	FLR1	P38124	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	GPB2	P39717	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD33	YML011C	RIM8	P53179	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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