RNA–Protein interactions for RNA: YJR119C

JHD2, Transcript of JmjC domain family histone demethylase, yeast

Gene JHD2, Length 2,187 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JHD2	YJR119C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RDS1	P25611	832 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	EMP47	P43555	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	HAP5	Q02516	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	APC11	Q12157	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	AI4	P03878	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	KEX1	P09620	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PDR1	P12383	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CLC1	P17891	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RAD53	P22216	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CHS3	P29465	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	DID4	P36108	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MAL33	P38157	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CST26	P38226	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PRE3	P38624	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	NIT1	P40447	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CIR1	P42940	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	FOL1	P53848	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	VPS30	Q02948	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	LAP2	Q10740	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CIT1	P00890	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	KIN1	P13185	1064 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RGP1	P16664	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YGR273C	P53329	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	ISW1	P38144	1129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RXT2	P38255	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RSM25	P40496	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PCI8	P40512	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MID1	P41821	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	GIS4	Q04233	774 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CSC1	Q06538	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CDC6	P09119	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
JHD2	YJR119C	CBP3	P21560	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MBR1	P23493	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	VPS45	P38932	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	NUC1	P08466	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	GAL2	P13181	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PUS5	Q06244	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RPN12	P32496	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	ACA1	P39970	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	VHR2	P40041	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SUE1	Q06524	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	DCS2	Q12123	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	DSE3	Q08729	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	TRS33	Q99394	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PES4	P39684	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PEA2	P40091	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	ASE1	P50275	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	RSC1	P53236	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	PEX29	Q03370	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	CEX1	Q12453	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	NHA1	Q99271	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
JHD2	YJR119C	ERG12	P07277	443 aa		4.84	□□□□□ -1.64
JHD2	YJR119C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
JHD2	YJR119C	ELM1	P32801	640 aa		4.84	□□□□□ -1.64
JHD2	YJR119C	SAS3	P34218	831 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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