RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	ADD66	P36040	267 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	YJR107W	P47145	328 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RKM2	Q03942	479 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RAD2	P07276	1031 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RDH54	P38086	958 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	CYC8	P14922	966 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	PIC2	P40035	300 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	EST2	Q06163	884 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	VPS53	P47061	822 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	CTH1	P47976	325 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	YNR063W	P53749	607 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	YVC1	Q12324	675 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	MCM2	P29469	868 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	EAR1	Q03212	550 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	TPP1	Q03796	238 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	TRE1	Q08919	783 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YJR087W	YJR087W	ADP1	P25371	1049 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	PEP7	P32609	515 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	SEC8	P32855	1065 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	ENT3	P47160	408 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	RMD1	Q03441	430 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	SDH1	Q00711	640 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	SPR28	Q04921	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	PEX7	P39108	375 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	FYV10	P40492	516 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	SIW14	P53965	281 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	SSY1	Q03770	852 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	HDA2	Q06629	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	MRL1	Q06815	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	PTC5	Q12511	572 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	RAD27	P26793	382 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	PRO1	P32264	428 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	MDL2	P33311	773 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	YHL012W	P38709	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	AFG2	P32794	780 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YJR087W	YJR087W	GCR1	P07261	785 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	HSP78	P33416	811 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	ALG3	P38179	458 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	PTC7	P38797	343 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	YJL045W	P47052	634 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	ORC3	P54790	616 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	ROD1	Q02805	837 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	SAM35	P14693	329 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	KIP1	P28742	1111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	MKK2	P32491	506 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	YSC84	P32793	468 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	GTS1	P40956	396 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	AVT1	P47082	602 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	ECL1	P48235	211 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	DFG16	Q99234	619 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	COQ4	O13525	335 aa		5	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	SEA4	P38164	1038 aa		5	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	GNP1	P48813	663 aa		5	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	PET112	P33893	541 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	MNR2	P35724	969 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	RGD1	P38339	666 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	HXT13	P39924	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	CNN1	P43618	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	TNA1	P53322	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	HXT17	P53631	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	HXT15	P54854	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YJR087W	YJR087W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	LRG1	P35688	1017 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	CCZ1	P38273	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	IRC24	P40580	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	SPO21	Q12411	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YJR087W	YJR087W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected

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