RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	RLF2	Q12495	606 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	HSE1	P38753	452 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	YAR028W	P39548	234 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	DUS4	Q06063	367 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	PMT7	Q06644	662 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	RSC58	Q07979	502 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	LST4	P34239	828 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	RSC4	Q02206	625 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YJL135W	YJL135W	CPS1	P27614	576 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	YKL077W	P36081	392 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	ATF1	P40353	525 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	TMA10	Q06177	86 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	PPM2	Q08282	695 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	CDC20	P26309	610 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	YAF9	P53930	226 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	ROT1	Q03691	256 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	RXT3	Q07458	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	OAR1	P35731	278 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	SHU2	P38957	223 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	PHO23	P50947	330 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	KIN4	Q01919	800 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	EXO5	P38289	585 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	SLS1	P42900	643 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	YJL045W	P47052	634 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	LAP2	Q10740	671 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	MOH1	P38191	138 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	NUT1	P53114	1132 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	UFD2	P54860	961 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	PLB2	Q03674	706 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	DCG1	P32460	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	YSC84	P32793	468 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	CCZ1	P38273	704 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	NEM1	P38757	446 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	MSS4	P38994	779 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	UBA2	P52488	636 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	COQ4	O13525	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	FLP1	P03870	423 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	YML083C	Q04526	418 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	GPB1	Q08886	897 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YJL135W	YJL135W	CDC6	P09119	513 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	ACF4	P47129	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	ATG1	P53104	897 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	GAL10	P04397	699 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	ATG14	P38270	344 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	BOL3	P39724	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	IOC3	P43596	787 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	RSM24	Q03976	319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	BSC2	Q05611	235 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	RSB1	Q08417	382 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	BAP2	P38084	609 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	VPS53	P47061	822 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	VPS62	P53285	467 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	YLR224W	Q05947	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	CMP2	P14747	604 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	XKS1	P42826	600 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	YNL011C	P53980	444 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	YAP6	Q03935	383 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	SRM1	P21827	482 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	STU2	P46675	888 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL135W	YJL135W	PIK1	P39104	1066 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	TNA1	P53322	534 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	CDC55	Q00362	526 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	RKM2	Q03942	479 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	MNL2	Q12205	849 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	GEF1	P37020	779 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	RFC5	P38251	354 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	AIM39	Q08223	395 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	HMI1	Q12039	706 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL135W	YJL135W	QDR1	P40475	563 aa		3	□□□□□ -1.93

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