RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR213W	YHR213W	RKM2	Q03942	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
YHR213W	YHR213W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	MET4	P32389	672 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	PTC7	P38797	343 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	XKS1	P42826	600 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	DAK2	P43550	591 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHR213W	YHR213W	MDL2	P33311	773 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	YHL012W	P38709	493 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	PEX28	P38848	579 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	THI12	P42883	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	THI5	P43534	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	VPS53	P47061	822 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	THI11	P47183	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	ADI1	Q03677	179 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	THI13	Q07748	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	ADD66	P36040	267 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	GTS1	P40956	396 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	TAF13	P11747	167 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	UGA4	P32837	571 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	SLD2	P34252	453 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	RDH54	P38086	958 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	YGL140C	P53120	1219 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	CDA2	Q06703	312 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	SAM35	P14693	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	ENV11	P53246	860 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	WHI5	Q12416	295 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	YNR063W	P53749	607 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	EST2	Q06163	884 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	MCD1	Q12158	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHR213W	YHR213W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YJL045W	P47052	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	MRPL22	P53881	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	COQ4	O13525	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YSC84	P32793	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YGR122W	P53272	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	SNO2	P53823	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
YHR213W	YHR213W	YML020W	Q03722	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YCR015C	P25616	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	AIM26	P32858	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YKL222C	P35995	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	CCZ1	P38273	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	FAA3	P39002	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	MRPS18	P42847	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	ENT3	P47160	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	RIM8	P53179	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	TOS4	Q06266	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	RSC58	Q07979	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	ESC8	Q08119	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	IPL1	P38991	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	PTC5	Q12511	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	SOD2	P00447	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	THI80	P35202	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	MGE1	P38523	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	PIC2	P40035	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	KIP1	P28742	1111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	AFG2	P32794	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	TNA1	P53322	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	INO80	P53115	1489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YHR213W	YHR213W	BAP2	P38084	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	ALG3	P38179	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	HNT2	P49775	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YHR213W	YHR213W	PIK1	P39104	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	SIW14	P53965	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	RSB1	Q08417	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	RAD2	P07276	1031 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	GIP4	P39732	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHR213W	YHR213W	HDA2	Q06629	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.2 ms