RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	KRE5	P22023	1365 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	PAF1	P38351	445 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	SOH1	P38633	127 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	ALG12	P53730	551 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	HDA3	Q06623	655 aa		5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	BCK1	Q01389	1478 aa		5.31	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	BLI1	P35727	113 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	MRPL16	P38064	232 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	GRX7	P38068	203 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RIA1	P53893	1110 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	NUP192	P47054	1683 aa		5.3	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	RAD9	P14737	1309 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	PUP1	P25043	261 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	BIO2	P32451	375 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	HOS4	P40480	1083 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YML083C	Q04526	418 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	COG4	Q06096	861 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	PSH1	Q12161	406 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	NKP1	Q12493	238 aa		5.29	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	MCM1	P11746	286 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	GRX4	P32642	244 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	MGE1	P38523	228 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YJL049W	P47048	450 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.28	□□□□□ -1.56	not detected
KTR2	YKR061W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	CAB1	Q04430	367 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	STB3	Q12427	513 aa		5.28	□□□□□ -1.56
KTR2	YKR061W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	CIT2	P08679	460 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	SPR3	P41901	512 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	ENT2	Q05785	613 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.27	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	ATE1	P16639	503 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	RPN12	P32496	274 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YTA6	P40328	754 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	DNM1	P54861	757 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	NHA1	Q99271	985 aa		5.26	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	SWI5	P08153	709 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	SEC8	P32855	1065 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TAT1	P38085	619 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	PPX1	P38698	397 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YHL050C	P38721	697 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YHR219W	P38900	624 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
KTR2	YKR061W	ERP4	Q12450	207 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.25	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.24	□□□□□ -1.57	not detected
KTR2	YKR061W	SEC6	P32844	805 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	ERP5	P38819	212 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	VAC8	P39968	578 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	MEH1	Q02205	184 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	RPN4	Q03465	531 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	NSE3	Q05541	303 aa		5.24	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
KTR2	YKR061W	ESL2	P36168	1195 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	LSB6	P42951	607 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	RIM21	P48565	533 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	YNL108C	P53929	270 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	HEH2	Q03281	663 aa		5.23	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	RGP1	P16664	663 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	OPI1	P21957	404 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TGL4	P36165	910 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	TAF5	P38129	798 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	MNN1	P39106	762 aa		5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
KTR2	YKR061W	IOC3	P43596	787 aa		5.22	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms