RNA–Protein interactions for RNA: YKL157W

APE2, Transcript of Aminopeptidase yscII, yeast

Gene APE2, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE2	YKL157W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	VPS72	Q03388	795 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	CTI6	Q08923	506 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	SWI3	P32591	825 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	AKR1	P39010	764 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	PKH1	Q03407	766 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	TLG2	Q08144	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	ATG9	Q12142	997 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	PTC5	Q12511	572 aa		4.1	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	FLO1	P32768	1537 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	CDC6	P09119	513 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
APE2	YKL157W	YKR075C	P36155	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	EFM4	P40516	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	RMP1	Q12530	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	CYB2	P00175	591 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	RGP1	P16664	663 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	COQ1	P18900	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	RAD51	P25454	400 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	HIR1	P32479	840 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	ERG5	P54781	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	GYL1	Q04322	720 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
APE2	YKL157W	ALG1	P16661	449 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	HXT1	P32465	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	DAK2	P43550	591 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	IRC8	P47046	822 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	SWH1	P35845	1188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	MYO3	P36006	1272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CAJ1	P39101	391 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	SEC9	P40357	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	HUL4	P40985	892 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	PRY3	P47033	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	TFC6	Q06339	672 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	HAT1	Q12341	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	ENT1	Q12518	454 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RXT2	P38255	430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	TDA3	P38758	523 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CTM1	P38818	585 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NDC80	P40460	691 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	OSW7	P43611	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	MMR1	Q06324	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	ATG23	Q06671	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	VAC14	Q06708	880 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NYV1	Q12255	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CEX1	Q12453	761 aa		4.08	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NFU1	P32860	256 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	YET1	P35723	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	HFM1	P51979	1187 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RBA50	Q04418	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	ENV9	Q08651	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NUR1	Q12066	484 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	GRX7	P38068	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	THI6	P41835	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	YGR237C	P50089	785 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	NGL3	Q03210	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	AFT2	Q08957	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RRI2	Q12348	645 aa		4.07	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CKI1	P20485	582 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RAD57	P25301	460 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CNS1	P33313	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	RGD1	P38339	666 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	YHL050C	P38721	697 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	YGL138C	P53122	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	PMD1	P32634	1753 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	COB	P00163	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	VFA1	P40080	203 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APE2	YKL157W	PCI8	P40512	444 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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