RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 YDR132CQ03900 495 aa3.79□□□□□ -1.8
Q0143Q0143 YOR352WQ08816 343 aa3.79□□□□□ -1.8
Q0143Q0143 ALG6Q12001 544 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
Q0143Q0143 RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
Q0143Q0143 URN1Q06525 465 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
Q0143Q0143 ISC10P32645 267 aa3.77□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 SMY2P32909 740 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 CHS7P38843 316 aa3.76□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 HXT8P40886 569 aa3.76□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 GAL2P13181 574 aa3.75□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 ATF1P40353 525 aa3.75□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 RGD2P43556 714 aa3.75□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 YIG1Q08956 461 aa3.75□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 NTO1Q12311 748 aa3.74□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 MEC3Q02574 474 aa3.73□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 GCN5Q03330 439 aa3.73□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 PYC2P32327 1180 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 NNK1P36003 928 aa3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 MEF2P39677 819 aa3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 ELA1P53861 379 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 PPM2Q08282 695 aa3.72□□□□□ -1.81
Q0143Q0143 TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 LAM1P38851 1228 aa3.7□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 SGD1Q06132 899 aa3.7□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 PUS7Q08647 676 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 NTA1P40354 457 aa3.69□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 MCM6P53091 1017 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 TPP1Q03796 238 aa3.69□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 AIM26P32858 118 aa3.68□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 YGR045CP53229 120 aa3.68□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data3.67□□□□□ -1.82not detected
Q0143Q0143 YHL012WP38709 493 aa3.67□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 ALD4P46367 519 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 MNN10P50108 393 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 AVO1Q08236 1176 aa3.66□□□□□ -1.82
Q0143Q0143 SAM35P14693 329 aa3.65□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 IOC3P43596 787 aa3.65□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 PHO23P50947 330 aa3.65□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 UBA2P52488 636 aa3.65□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 MDL2P33311 773 aa3.64□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 RAD55P38953 406 aa3.64□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 ATG32P40458 529 aa3.64□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 TMA10Q06177 86 aa3.64□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 DOM34P33309 386 aa3.63□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 BIM1P40013 344 aa3.63□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 PSY2P40164 858 aa3.63□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 KIN4Q01919 800 aa3.63□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 STE11P23561 717 aa3.62□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 OAR1P35731 278 aa3.62□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 SUT1P53032 299 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 LST4P34239 828 aa3.61□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 MOH1P38191 138 aa3.61□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 ENV11P53246 860 aa3.61□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.61□□□□□ -1.83not detected
Q0143Q0143 ROT1Q03691 256 aa3.61□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 SRS2P12954 1174 aa3.6□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 NPR1P22211 790 aa3.59□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 NMD3P38861 518 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 ECM23Q02710 187 aa3.59□□□□□ -1.83
Q0143Q0143 SPS1P08458 490 aa3.58□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 SIS2P36024 562 aa3.58□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 DUS4Q06063 367 aa3.58□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 MSS4P38994 779 aa3.57□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 KTR2P33550 425 aa3.56□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 HNT2P49775 206 aa3.56□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 CDC20P26309 610 aa3.55□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 UBX7P38349 436 aa3.55□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 PUN1Q06991 263 aa3.55□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 CMR1Q12510 522 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 SRO9P25567 434 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 RIM11P38615 370 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 CTR9P89105 1077 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 PLB2Q03674 706 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 RXT3Q07458 294 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 YAP7Q08182 245 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 AFT2Q08957 416 aa3.53□□□□□ -1.84
Q0143Q0143 SMC1P32908 1225 aa3.52□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 PRP5P21372 849 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 TGL4P36165 910 aa3.51□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 ARL1P38116 183 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 STU2P46675 888 aa3.5□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 RSC58Q07979 502 aa3.5□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 ECM2P38241 364 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Q0143Q0143 DCG1P32460 244 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36 ms