RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	SND1	Q04007	877 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	YPL066W	Q12194	479 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	EUG1	P32474	517 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	YBR184W	P38299	523 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	APM2	P38700	605 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	SPR3	P41901	512 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	YNL165W	P53891	406 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	MDM12	Q92328	271 aa		3.41	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	SWI5	P08153	709 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	KIP2	P28743	706 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	ISC10	P32645	267 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	PET112	P33893	541 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	ATG3	P40344	310 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	UFD2	P54860	961 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	PSR1	Q07800	427 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	FMP25	Q08023	583 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	SRF1	Q12516	437 aa		3.4	□□□□□ -1.86
AI2	Q0055	MRPL33	P20084	86 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	CLN2	P20438	545 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TRK2	P28584	889 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NTH2	P35172	780 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YKL222C	P35995	705 aa		3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	GAL1	P04385	528 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PRI2	P20457	528 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SRM1	P21827	482 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	HIR1	P32479	840 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	AFR1	P33304	620 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MAL31	P38156	614 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ATG16	Q03818	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SDH5	Q08230	162 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YLR125W	Q12138	136 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PSH1	Q12161	406 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	HIF1	Q12373	385 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	FLP1	P03870	423 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MSS18	P08593	268 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PES4	P39684	611 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	CAF120	P53836	1060 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SHE9	Q04172	456 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ERP4	Q12450	207 aa		3.39	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	CCC2	P38995	1004 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ACO2	P39533	789 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MAD1	P40957	749 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YJR115W	P47152	169 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MSH6	Q03834	1242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	REC8	Q12188	680 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ADR1	P07248	1323 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	VAN1	P23642	535 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YBL086C	P38177	466 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PIP2	P52960	996 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	UGO1	Q03327	502 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SPO20	Q04359	397 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ATG20	Q07528	640 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	HVG1	P0CE11	249 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RPC31	P17890	251 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	MIH1	P23748	554 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	AGP1	P25376	633 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	KCC4	P25389	1037 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	VMA3	P25515	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	IMP2'	P32351	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	FBP26	P32604	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	HSP78	P33416	811 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YNL193W	P53870	558 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	ULP1	Q02724	621 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	BRE4	Q07660	1125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PSK2	Q08217	1101 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	RTP1	Q12751	981 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	TOP3	P13099	656 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NUT1	P53114	1132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	NPY1	P53164	384 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AI2	Q0055	YGR035C	P53222	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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