RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176549.1

Gm28727-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm28727, Length 443 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gimap6Q8K349 305 aa16.43■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Akt1s1Q9D1F4 257 aa16.43■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa16.42■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 IncenpQ9WU62 880 aa16.42■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Map3k19E9Q3S4 1311 aa16.42■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Sik1Q60670 779 aa16.41■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ppm1fQ8CGA0 452 aa16.41■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Exoc5Q3TPX4 708 aa16.4■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gpr162Q3UN16 588 aa16.4■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ptpn23Q6PB44 1692 aa16.4■□□□□ 0.22
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa16.39■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ankrd13dQ6PD24 605 aa16.39■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Usp21Q9QZL6 566 aa16.39■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 CatipB9EKE5 520 aa16.38■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gsto1O09131 240 aa16.38■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Egfem1Q8C088 590 aa16.38■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Fam122aQ9DB52 284 aa16.38■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 UtrnE9Q6R7 3430 aa16.37■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Chrna2Q91X60 512 aa16.36■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 TnrQ8BYI9 1358 aa16.36■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Magea6O89010 325 aa16.35■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Magea3Q6T340 320 aa16.35■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Nlgn1Q99K10 843 aa16.35■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa16.34■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Arfgef2A2A5R2 1792 aa16.33■□□□□ 0.21
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Dennd6aQ8BH65 605 aa16.33■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa16.33■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ginm1Q91WR6 327 aa16.32■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Usp47Q8BY87 1376 aa16.31■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tmem132eQ6IEE6 982 aa16.31■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 FancaQ9JL70 1439 aa16.3■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 CrklP47941 303 aa16.3■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa16.3■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 CenpjQ569L8 1344 aa16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zpr1Q62384 459 aa16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 OptnQ8K3K8 584 aa16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 TatQ8QZR1 454 aa16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cabp4Q8VHC5 271 aa16.29■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Nphp4P59240 1425 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kif16bB1AVY7 1312 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Msl1Q6PDM1 616 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 ErfeQ6PGN1 340 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kcnh5Q920E3 988 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Nsd3Q6P2L6 1439 aa16.28■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Fmnl2A2APV2 1086 aa16.27■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Neurod1Q60867 357 aa16.27■□□□□ 0.2
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mst1rQ62190 1378 aa16.26■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Adgre1Q61549 931 aa16.26■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kcnn1Q9EQR3 537 aa16.26■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cnga1P29974 684 aa16.25■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Prom2Q3UUY6 835 aa16.25■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Sos2Q02384 1333 aa16.24■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Col23a1Q8K4G2 532 aa16.24■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 FocadA2AKG8 1798 aa16.23■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kcnh4A2A5F7 1018 aa16.23■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zranb3Q6NZP1 1069 aa16.23■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Podxl2Q8CAE9 603 aa16.22■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Slit1Q80TR4 1531 aa16.22■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa16.21■□□□□ 0.19
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa16.2■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa16.2■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Znf335A2A5K6 1337 aa16.19■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Abca3Q8R420 1704 aa16.19■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 FanciQ8K368 1330 aa16.19■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Eid3Q3V124 375 aa16.18■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Shank3Q4ACU6 1730 aa16.18■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 VwdeQ6DFV8 926 aa16.17■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Map2P20357 1828 aa16.17■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Plekhd1B2RPU2 505 aa16.16■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 WasP70315 520 aa16.16■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Jdp2P97875 163 aa16.15■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.15■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Fam50bQ9WTJ8 334 aa16.15■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ubr1O70481 1757 aa16.15■□□□□ 0.18
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Col15a1O35206 1367 aa16.14■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 MeiocA2AG06 965 aa16.14■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ccer2J3QPU5 274 aa16.14■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa16.14■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Casz1Q9CWL2 1761 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cyp2c69E9PXC3 491 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cyp2c40P56657 491 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Camkk2Q8C078 588 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Spon1Q8VCC9 807 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Igsf1Q7TQA1 1317 aa16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tns2Q8CGB6 1400 aa16.11■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Itgb4A2A863 1818 aa16.11■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ano8Q6PB70 1060 aa16.1■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Sumf1Q8R0F3 372 aa16.1■□□□□ 0.17
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.7 ms