Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
UtrnE9Q6R7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
UtrnE9Q6R7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
UtrnE9Q6R7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
UtrnE9Q6R7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
UtrnE9Q6R7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
UtrnE9Q6R7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
UtrnE9Q6R7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
UtrnE9Q6R7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
UtrnE9Q6R7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
UtrnE9Q6R7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
UtrnE9Q6R7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
UtrnE9Q6R7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
UtrnE9Q6R7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
UtrnE9Q6R7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
UtrnE9Q6R7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
UtrnE9Q6R7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
UtrnE9Q6R7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
UtrnE9Q6R7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
UtrnE9Q6R7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
UtrnE9Q6R7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
UtrnE9Q6R7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
UtrnE9Q6R7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
UtrnE9Q6R7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
UtrnE9Q6R7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
UtrnE9Q6R7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
UtrnE9Q6R7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
UtrnE9Q6R7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
UtrnE9Q6R7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
UtrnE9Q6R7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
UtrnE9Q6R7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
UtrnE9Q6R7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
UtrnE9Q6R7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
UtrnE9Q6R7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
UtrnE9Q6R7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
UtrnE9Q6R7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
UtrnE9Q6R7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
UtrnE9Q6R7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
UtrnE9Q6R7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
UtrnE9Q6R7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
UtrnE9Q6R7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
UtrnE9Q6R7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UtrnE9Q6R7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UtrnE9Q6R7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
UtrnE9Q6R7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
UtrnE9Q6R7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
UtrnE9Q6R7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
UtrnE9Q6R7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
UtrnE9Q6R7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
UtrnE9Q6R7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
UtrnE9Q6R7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
UtrnE9Q6R7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
UtrnE9Q6R7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
UtrnE9Q6R7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
UtrnE9Q6R7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
UtrnE9Q6R7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
UtrnE9Q6R7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
UtrnE9Q6R7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
UtrnE9Q6R7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
UtrnE9Q6R7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
UtrnE9Q6R7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
UtrnE9Q6R7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
UtrnE9Q6R7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
UtrnE9Q6R7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
UtrnE9Q6R7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UtrnE9Q6R7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
UtrnE9Q6R7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
UtrnE9Q6R7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
UtrnE9Q6R7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
UtrnE9Q6R7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
UtrnE9Q6R7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
UtrnE9Q6R7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
UtrnE9Q6R7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
UtrnE9Q6R7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
UtrnE9Q6R7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
UtrnE9Q6R7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
UtrnE9Q6R7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
UtrnE9Q6R7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
UtrnE9Q6R7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
UtrnE9Q6R7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
UtrnE9Q6R7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
UtrnE9Q6R7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UtrnE9Q6R7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
UtrnE9Q6R7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
UtrnE9Q6R7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
UtrnE9Q6R7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
UtrnE9Q6R7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
UtrnE9Q6R7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
UtrnE9Q6R7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
UtrnE9Q6R7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UtrnE9Q6R7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
UtrnE9Q6R7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
UtrnE9Q6R7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
UtrnE9Q6R7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
UtrnE9Q6R7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
UtrnE9Q6R7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
UtrnE9Q6R7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
UtrnE9Q6R7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
UtrnE9Q6R7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
UtrnE9Q6R7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms