Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,61■■■■■ 5,37
UtrnE9Q6R7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,33■■■■■ 4,85
UtrnE9Q6R7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,5■■■■■ 4,71
UtrnE9Q6R7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,86■■■■■ 4,45
UtrnE9Q6R7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
UtrnE9Q6R7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
UtrnE9Q6R7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,14■■■■■ 4,18
UtrnE9Q6R7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
UtrnE9Q6R7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
UtrnE9Q6R7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,33■■■■■ 4,05
UtrnE9Q6R7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
UtrnE9Q6R7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,22■■■■■ 4,03
UtrnE9Q6R7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
UtrnE9Q6R7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
UtrnE9Q6R7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,04■■■■■ 4
UtrnE9Q6R7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,83■■■■□ 3,97
UtrnE9Q6R7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,98■■■■□ 3,83
UtrnE9Q6R7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
UtrnE9Q6R7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
UtrnE9Q6R7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
UtrnE9Q6R7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
UtrnE9Q6R7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,36■■■■□ 3,73
UtrnE9Q6R7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,99■■■■□ 3,67
UtrnE9Q6R7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
UtrnE9Q6R7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,92■■■■□ 3,66
UtrnE9Q6R7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
UtrnE9Q6R7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,53■■■■□ 3,6
UtrnE9Q6R7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
UtrnE9Q6R7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37,35■■■■□ 3,57
UtrnE9Q6R7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,34■■■■□ 3,57
UtrnE9Q6R7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37,22■■■■□ 3,55
UtrnE9Q6R7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC37,1■■■■□ 3,53
UtrnE9Q6R7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,88■■■■□ 3,49
UtrnE9Q6R7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
UtrnE9Q6R7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
UtrnE9Q6R7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
UtrnE9Q6R7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
UtrnE9Q6R7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
UtrnE9Q6R7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
UtrnE9Q6R7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36,64■■■■□ 3,46
UtrnE9Q6R7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
UtrnE9Q6R7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
UtrnE9Q6R7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
UtrnE9Q6R7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
UtrnE9Q6R7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,28■■■■□ 3,4
UtrnE9Q6R7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
UtrnE9Q6R7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
UtrnE9Q6R7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
UtrnE9Q6R7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
UtrnE9Q6R7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
UtrnE9Q6R7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
UtrnE9Q6R7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
UtrnE9Q6R7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
UtrnE9Q6R7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,84■■■■□ 3,33
UtrnE9Q6R7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
UtrnE9Q6R7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,31
UtrnE9Q6R7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,73■■■■□ 3,31
UtrnE9Q6R7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,73■■■■□ 3,31
UtrnE9Q6R7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
UtrnE9Q6R7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
UtrnE9Q6R7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
UtrnE9Q6R7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
UtrnE9Q6R7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
UtrnE9Q6R7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
UtrnE9Q6R7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
UtrnE9Q6R7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
UtrnE9Q6R7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,32■■■■□ 3,25
UtrnE9Q6R7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
UtrnE9Q6R7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
UtrnE9Q6R7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
UtrnE9Q6R7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
UtrnE9Q6R7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
UtrnE9Q6R7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
UtrnE9Q6R7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
UtrnE9Q6R7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
UtrnE9Q6R7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
UtrnE9Q6R7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,03■■■■□ 3,2
UtrnE9Q6R7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
UtrnE9Q6R7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
UtrnE9Q6R7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
UtrnE9Q6R7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,18
UtrnE9Q6R7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
UtrnE9Q6R7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
UtrnE9Q6R7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,79■■■■□ 3,16
UtrnE9Q6R7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,78■■■■□ 3,16
UtrnE9Q6R7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
UtrnE9Q6R7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
UtrnE9Q6R7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
UtrnE9Q6R7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,57■■■■□ 3,12
UtrnE9Q6R7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
UtrnE9Q6R7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,53■■■■□ 3,12
UtrnE9Q6R7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
UtrnE9Q6R7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
UtrnE9Q6R7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
UtrnE9Q6R7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
UtrnE9Q6R7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
UtrnE9Q6R7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
UtrnE9Q6R7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
UtrnE9Q6R7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,34■■■■□ 3,09
UtrnE9Q6R7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms