RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnai3Q9DC51 354 aa27.74■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Terf2O35144 541 aa27.73■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd44B2RXR6 993 aa27.72■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp16Q99LG0 825 aa27.72■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph6aQ8CDR2 708 aa27.72■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhdc4Q921I2 584 aa27.71■■■□□ 2.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph4aQ8BYM7 716 aa27.69■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spef2Q8C9J3 1734 aa27.68■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Psme1P97371 249 aa27.68■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Idi2Q8BFZ6 227 aa27.68■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr63B2RY71 923 aa27.66■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wwc1Q5SXA9 1104 aa27.66■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Txndc2Q6P902 515 aa27.65■■■□□ 2.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IghaA0A0A6YXW6 389 aa27.64■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif1aP33173 1695 aa27.63■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LifrP42703 1092 aa27.63■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rfx1P48377 963 aa27.63■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim27Q62158 513 aa27.62■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27.61■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NpatQ8BMA5 1420 aa27.61■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cetn4Q8K4K1 168 aa27.61■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MpripP97434 1024 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ric3Q8BPM6 367 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10093D3YYI8 482 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssh1Q76I79 1042 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GorabQ8BRM2 368 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nek4Q9Z1J2 792 aa27.6■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtpruB1AUH1 1446 aa27.59■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RictorQ6QI06 1708 aa27.59■■■□□ 2.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4a2P10630 407 aa27.57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amer1Q7TS75 1132 aa27.57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aifm3Q3TY86 605 aa27.57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa27.56■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc146E9Q9F7 977 aa27.55■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CatipB9EKE5 520 aa27.54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk31Q99MW1 1018 aa27.54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcm4P49717 862 aa27.53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif24Q6NWW5 1356 aa27.53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sos1Q62245 1319 aa27.53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27.52■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Triml2E9PW10 424 aa27.51■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddit3P35639 168 aa27.51■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcb2A3KGF7 1181 aa27.5■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pibf1E9Q6K3 756 aa27.5■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FanclQ9CR14 375 aa27.5■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hoxb7P09024 217 aa27.49■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa27.48■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NgefQ8CHT1 710 aa27.47■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cps1Q8C196 1500 aa27.46■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.45■■□□□ 1.99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa27.45■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh8a1Q8BH00 487 aa27.44■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chl1P70232 1209 aa27.44■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ggnbp2Q5SV77 696 aa27.43■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cgnl1Q6AW69 1298 aa27.43■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ipo4Q8VI75 1082 aa27.43■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam13aQ8BGI4 693 aa27.43■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph3aQ3UFY4 516 aa27.42■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh1l2Q8K009 923 aa27.41■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa27.41■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenppQ9CZ92 286 aa27.41■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.41■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tm6sf1P58749 370 aa27.4■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il4rP16382 810 aa27.39■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa27.39■■□□□ 1.98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prim1P20664 417 aa27.38■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fgd1P52734 960 aa27.38■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa27.38■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gcc1Q9D4H2 778 aa27.38■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snap23O09044 210 aa27.37■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prkar2bP31324 416 aa27.37■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Astn2Q80Z10 1352 aa27.37■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EngaseQ8BX80 734 aa27.36■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Med1Q925J9 1575 aa27.36■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Parp14Q2EMV9 1817 aa27.35■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q3UJC8 639 aa27.35■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa27.35■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp6r3Q922D4 844 aa27.35■■□□□ 1.97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.6 ms