RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnai3Q9DC51 354 aa27,74■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Terf2O35144 541 aa27,73■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd44B2RXR6 993 aa27,72■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP27,72■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp16Q99LG0 825 aa27,72■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph6aQ8CDR2 708 aa27,72■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP27,72■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhdc4Q921I2 584 aa27,71■■■□□ 2,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP27,7■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph4aQ8BYM7 716 aa27,69■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spef2Q8C9J3 1734 aa27,68■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Psme1P97371 249 aa27,68■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Idi2Q8BFZ6 227 aa27,68■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr63B2RY71 923 aa27,66■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wwc1Q5SXA9 1104 aa27,66■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP27,66■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Txndc2Q6P902 515 aa27,65■■■□□ 2,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IghaA0A0A6YXW6 389 aa27,64■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27,64■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif1aP33173 1695 aa27,63■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LifrP42703 1092 aa27,63■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rfx1P48377 963 aa27,63■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP27,62■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim27Q62158 513 aa27,62■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27,61■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP27,61■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NpatQ8BMA5 1420 aa27,61■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cetn4Q8K4K1 168 aa27,61■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MpripP97434 1024 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ric3Q8BPM6 367 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10093D3YYI8 482 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssh1Q76I79 1042 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GorabQ8BRM2 368 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nek4Q9Z1J2 792 aa27,6■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtpruB1AUH1 1446 aa27,59■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RictorQ6QI06 1708 aa27,59■■■□□ 2,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP27,58■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4a2P10630 407 aa27,57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Amer1Q7TS75 1132 aa27,57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP27,57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aifm3Q3TY86 605 aa27,57■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa27,56■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc146E9Q9F7 977 aa27,55■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27,54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CatipB9EKE5 520 aa27,54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk31Q99MW1 1018 aa27,54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP27,54■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mcm4P49717 862 aa27,53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif24Q6NWW5 1356 aa27,53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sos1Q62245 1319 aa27,53■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa27,52■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP27,52■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Triml2E9PW10 424 aa27,51■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddit3P35639 168 aa27,51■■■□□ 2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plcb2A3KGF7 1181 aa27,5■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pibf1E9Q6K3 756 aa27,5■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP27,5■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FanclQ9CR14 375 aa27,5■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hoxb7P09024 217 aa27,49■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP27,48■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP27,48■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa27,48■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NgefQ8CHT1 710 aa27,47■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP27,46■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cps1Q8C196 1500 aa27,46■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dip2bQ3UH60 1574 aa27,45■■□□□ 1,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa27,45■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh8a1Q8BH00 487 aa27,44■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chl1P70232 1209 aa27,44■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP27,44■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP27,44■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ggnbp2Q5SV77 696 aa27,43■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cgnl1Q6AW69 1298 aa27,43■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ipo4Q8VI75 1082 aa27,43■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam13aQ8BGI4 693 aa27,43■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph3aQ3UFY4 516 aa27,42■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aldh1l2Q8K009 923 aa27,41■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa27,41■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenppQ9CZ92 286 aa27,41■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27,41■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP27,4■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tm6sf1P58749 370 aa27,4■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il4rP16382 810 aa27,39■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa27,39■■□□□ 1,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prim1P20664 417 aa27,38■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fgd1P52734 960 aa27,38■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa27,38■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gcc1Q9D4H2 778 aa27,38■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snap23O09044 210 aa27,37■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prkar2bP31324 416 aa27,37■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Astn2Q80Z10 1352 aa27,37■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EngaseQ8BX80 734 aa27,36■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Med1Q925J9 1575 aa27,36■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Parp14Q2EMV9 1817 aa27,35■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q3UJC8 639 aa27,35■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa27,35■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp6r3Q922D4 844 aa27,35■■□□□ 1,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa27,35■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,3 ms