Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAA7

Stk11ip, Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk11ipQ3TAA7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Stk11ipQ3TAA7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Stk11ipQ3TAA7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Stk11ipQ3TAA7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Stk11ipQ3TAA7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Stk11ipQ3TAA7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Stk11ipQ3TAA7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Stk11ipQ3TAA7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Stk11ipQ3TAA7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Stk11ipQ3TAA7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Stk11ipQ3TAA7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Stk11ipQ3TAA7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Stk11ipQ3TAA7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Stk11ipQ3TAA7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Stk11ipQ3TAA7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Stk11ipQ3TAA7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Stk11ipQ3TAA7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Stk11ipQ3TAA7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Stk11ipQ3TAA7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Stk11ipQ3TAA7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Stk11ipQ3TAA7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Stk11ipQ3TAA7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Stk11ipQ3TAA7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Stk11ipQ3TAA7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Stk11ipQ3TAA7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Stk11ipQ3TAA7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Stk11ipQ3TAA7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Stk11ipQ3TAA7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Stk11ipQ3TAA7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Stk11ipQ3TAA7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Stk11ipQ3TAA7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Stk11ipQ3TAA7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Stk11ipQ3TAA7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Stk11ipQ3TAA7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Stk11ipQ3TAA7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Stk11ipQ3TAA7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Stk11ipQ3TAA7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Stk11ipQ3TAA7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Stk11ipQ3TAA7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Stk11ipQ3TAA7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Stk11ipQ3TAA7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Stk11ipQ3TAA7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Stk11ipQ3TAA7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Stk11ipQ3TAA7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Stk11ipQ3TAA7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Stk11ipQ3TAA7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Stk11ipQ3TAA7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Stk11ipQ3TAA7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Stk11ipQ3TAA7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Stk11ipQ3TAA7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Stk11ipQ3TAA7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Stk11ipQ3TAA7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Stk11ipQ3TAA7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Stk11ipQ3TAA7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Stk11ipQ3TAA7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Stk11ipQ3TAA7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Stk11ipQ3TAA7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Stk11ipQ3TAA7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stk11ipQ3TAA7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stk11ipQ3TAA7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stk11ipQ3TAA7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Stk11ipQ3TAA7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Stk11ipQ3TAA7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Stk11ipQ3TAA7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Stk11ipQ3TAA7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stk11ipQ3TAA7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stk11ipQ3TAA7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Stk11ipQ3TAA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stk11ipQ3TAA7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Stk11ipQ3TAA7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Stk11ipQ3TAA7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Stk11ipQ3TAA7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Stk11ipQ3TAA7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Stk11ipQ3TAA7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Stk11ipQ3TAA7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Stk11ipQ3TAA7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Stk11ipQ3TAA7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Stk11ipQ3TAA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Stk11ipQ3TAA7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Stk11ipQ3TAA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Stk11ipQ3TAA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Stk11ipQ3TAA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Stk11ipQ3TAA7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Stk11ipQ3TAA7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Stk11ipQ3TAA7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Stk11ipQ3TAA7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Stk11ipQ3TAA7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Stk11ipQ3TAA7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Stk11ipQ3TAA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Stk11ipQ3TAA7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Stk11ipQ3TAA7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Stk11ipQ3TAA7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Stk11ipQ3TAA7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Stk11ipQ3TAA7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Stk11ipQ3TAA7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms