Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI75

Ipo4, Importin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo4Q8VI75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,64■■■■□ 3,94
Ipo4Q8VI75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Ipo4Q8VI75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Ipo4Q8VI75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Ipo4Q8VI75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
Ipo4Q8VI75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Ipo4Q8VI75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Ipo4Q8VI75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Ipo4Q8VI75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Ipo4Q8VI75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Ipo4Q8VI75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Ipo4Q8VI75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ipo4Q8VI75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ipo4Q8VI75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Ipo4Q8VI75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Ipo4Q8VI75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Ipo4Q8VI75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Ipo4Q8VI75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Ipo4Q8VI75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Ipo4Q8VI75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Ipo4Q8VI75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,56■■■■□ 3,12
Ipo4Q8VI75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ipo4Q8VI75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Ipo4Q8VI75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Ipo4Q8VI75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Ipo4Q8VI75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ipo4Q8VI75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ipo4Q8VI75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ipo4Q8VI75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Ipo4Q8VI75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Ipo4Q8VI75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Ipo4Q8VI75 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Ipo4Q8VI75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Ipo4Q8VI75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ipo4Q8VI75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Ipo4Q8VI75 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Ipo4Q8VI75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Ipo4Q8VI75 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Ipo4Q8VI75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Ipo4Q8VI75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Ipo4Q8VI75 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Ipo4Q8VI75 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Ipo4Q8VI75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Ipo4Q8VI75 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,89
Ipo4Q8VI75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Ipo4Q8VI75 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Ipo4Q8VI75 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Ipo4Q8VI75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Ipo4Q8VI75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Ipo4Q8VI75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Ipo4Q8VI75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Ipo4Q8VI75 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Ipo4Q8VI75 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Ipo4Q8VI75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Ipo4Q8VI75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Ipo4Q8VI75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Ipo4Q8VI75 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Ipo4Q8VI75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Ipo4Q8VI75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ipo4Q8VI75 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ipo4Q8VI75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,45■■■□□ 2,78
Ipo4Q8VI75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Ipo4Q8VI75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Ipo4Q8VI75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Ipo4Q8VI75 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Ipo4Q8VI75 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ipo4Q8VI75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Ipo4Q8VI75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ipo4Q8VI75 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Ipo4Q8VI75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ipo4Q8VI75 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Ipo4Q8VI75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,73
Ipo4Q8VI75 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Ipo4Q8VI75 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Ipo4Q8VI75 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Ipo4Q8VI75 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Ipo4Q8VI75 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Ipo4Q8VI75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ipo4Q8VI75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Ipo4Q8VI75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Ipo4Q8VI75 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Ipo4Q8VI75 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Ipo4Q8VI75 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Ipo4Q8VI75 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Ipo4Q8VI75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Ipo4Q8VI75 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Ipo4Q8VI75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Ipo4Q8VI75 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Ipo4Q8VI75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Ipo4Q8VI75 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,3 ms