Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4K1

Cetn4, Centrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn4Q8K4K1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,45■■■■■ 4,71
Cetn4Q8K4K1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,65■■■■■ 4,42
Cetn4Q8K4K1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Cetn4Q8K4K1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Cetn4Q8K4K1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Cetn4Q8K4K1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Cetn4Q8K4K1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Cetn4Q8K4K1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,69■■■■□ 3,94
Cetn4Q8K4K1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Cetn4Q8K4K1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Cetn4Q8K4K1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Cetn4Q8K4K1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Cetn4Q8K4K1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,63■■■■□ 3,77
Cetn4Q8K4K1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Cetn4Q8K4K1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Cetn4Q8K4K1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,15■■■■□ 3,7
Cetn4Q8K4K1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Cetn4Q8K4K1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Cetn4Q8K4K1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Cetn4Q8K4K1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Cetn4Q8K4K1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cetn4Q8K4K1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cetn4Q8K4K1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cetn4Q8K4K1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Cetn4Q8K4K1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Cetn4Q8K4K1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Cetn4Q8K4K1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cetn4Q8K4K1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Cetn4Q8K4K1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Cetn4Q8K4K1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Cetn4Q8K4K1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Cetn4Q8K4K1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Cetn4Q8K4K1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Cetn4Q8K4K1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Cetn4Q8K4K1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Cetn4Q8K4K1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cetn4Q8K4K1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cetn4Q8K4K1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Cetn4Q8K4K1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Cetn4Q8K4K1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cetn4Q8K4K1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Cetn4Q8K4K1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cetn4Q8K4K1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Cetn4Q8K4K1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Cetn4Q8K4K1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cetn4Q8K4K1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Cetn4Q8K4K1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cetn4Q8K4K1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cetn4Q8K4K1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Cetn4Q8K4K1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Cetn4Q8K4K1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Cetn4Q8K4K1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Cetn4Q8K4K1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Cetn4Q8K4K1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Cetn4Q8K4K1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Cetn4Q8K4K1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Cetn4Q8K4K1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Cetn4Q8K4K1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cetn4Q8K4K1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cetn4Q8K4K1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cetn4Q8K4K1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cetn4Q8K4K1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cetn4Q8K4K1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cetn4Q8K4K1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cetn4Q8K4K1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Cetn4Q8K4K1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cetn4Q8K4K1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Cetn4Q8K4K1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Cetn4Q8K4K1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Cetn4Q8K4K1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,96■■■■□ 3,19
Cetn4Q8K4K1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cetn4Q8K4K1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cetn4Q8K4K1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cetn4Q8K4K1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cetn4Q8K4K1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Cetn4Q8K4K1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cetn4Q8K4K1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cetn4Q8K4K1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cetn4Q8K4K1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Cetn4Q8K4K1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Cetn4Q8K4K1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Cetn4Q8K4K1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Cetn4Q8K4K1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Cetn4Q8K4K1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Cetn4Q8K4K1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Cetn4Q8K4K1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Cetn4Q8K4K1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Cetn4Q8K4K1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Cetn4Q8K4K1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Cetn4Q8K4K1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Cetn4Q8K4K1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Cetn4Q8K4K1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Cetn4Q8K4K1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms