Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6K3

Pibf1, Progesterone immunomodulatory-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pibf1E9Q6K3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49,22■■■■■ 5,47
Pibf1E9Q6K3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,49■■■■■ 4,87
Pibf1E9Q6K3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
Pibf1E9Q6K3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Pibf1E9Q6K3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,08■■■■■ 4,49
Pibf1E9Q6K3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,61■■■■■ 4,41
Pibf1E9Q6K3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Pibf1E9Q6K3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,18■■■■■ 4,34
Pibf1E9Q6K3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Pibf1E9Q6K3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,6■■■■■ 4,25
Pibf1E9Q6K3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Pibf1E9Q6K3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Pibf1E9Q6K3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41,05■■■■■ 4,16
Pibf1E9Q6K3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Pibf1E9Q6K3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Pibf1E9Q6K3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,21■■■■■ 4,03
Pibf1E9Q6K3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Pibf1E9Q6K3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Pibf1E9Q6K3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Pibf1E9Q6K3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Pibf1E9Q6K3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,73■■■■□ 3,95
Pibf1E9Q6K3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,71■■■■□ 3,95
Pibf1E9Q6K3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Pibf1E9Q6K3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Pibf1E9Q6K3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Pibf1E9Q6K3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Pibf1E9Q6K3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Pibf1E9Q6K3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Pibf1E9Q6K3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,24■■■■□ 3,87
Pibf1E9Q6K3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Pibf1E9Q6K3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Pibf1E9Q6K3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Pibf1E9Q6K3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Pibf1E9Q6K3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Pibf1E9Q6K3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Pibf1E9Q6K3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,59■■■■□ 3,77
Pibf1E9Q6K3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Pibf1E9Q6K3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Pibf1E9Q6K3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Pibf1E9Q6K3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Pibf1E9Q6K3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Pibf1E9Q6K3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Pibf1E9Q6K3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Pibf1E9Q6K3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Pibf1E9Q6K3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Pibf1E9Q6K3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Pibf1E9Q6K3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
Pibf1E9Q6K3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Pibf1E9Q6K3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Pibf1E9Q6K3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Pibf1E9Q6K3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Pibf1E9Q6K3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Pibf1E9Q6K3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37,4■■■■□ 3,58
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Pibf1E9Q6K3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Pibf1E9Q6K3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Pibf1E9Q6K3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Pibf1E9Q6K3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Pibf1E9Q6K3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Pibf1E9Q6K3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Pibf1E9Q6K3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,09■■■■□ 3,53
Pibf1E9Q6K3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Pibf1E9Q6K3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,06■■■■□ 3,52
Pibf1E9Q6K3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Pibf1E9Q6K3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Pibf1E9Q6K3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Pibf1E9Q6K3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,94■■■■□ 3,5
Pibf1E9Q6K3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Pibf1E9Q6K3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Pibf1E9Q6K3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Pibf1E9Q6K3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Pibf1E9Q6K3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,86■■■■□ 3,49
Pibf1E9Q6K3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Pibf1E9Q6K3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Pibf1E9Q6K3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Pibf1E9Q6K3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Pibf1E9Q6K3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Pibf1E9Q6K3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Pibf1E9Q6K3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Pibf1E9Q6K3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
Pibf1E9Q6K3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,58■■■■□ 3,45
Pibf1E9Q6K3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Pibf1E9Q6K3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Pibf1E9Q6K3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Pibf1E9Q6K3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Pibf1E9Q6K3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pibf1E9Q6K3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pibf1E9Q6K3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pibf1E9Q6K3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Pibf1E9Q6K3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Pibf1E9Q6K3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Pibf1E9Q6K3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Pibf1E9Q6K3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pibf1E9Q6K3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Pibf1E9Q6K3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Pibf1E9Q6K3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Pibf1E9Q6K3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms