RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NischQ80TM9 1593 aa42,24■■■■■ 4,35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41,3■■■■■ 4,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc9P70170 1546 aa41■■■■■ 4,15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc8B2RUS7 1588 aa40,03■■■■■ 4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rhox8Q6VSS7 320 aa39,54■■■■□ 3,92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rtl1Q7M732 1744 aa38,94■■■■□ 3,82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc180J3QNE4 1664 aa38,34■■■■□ 3,73
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37,64■■■■□ 3,62
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScribQ80U72 1612 aa37,25■■■■□ 3,55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37,24■■■■□ 3,55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37,05■■■■□ 3,52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa36,69■■■■□ 3,46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5dQ62240 1548 aa36,59■■■■□ 3,45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa36,58■■■■□ 3,45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Baz1aO88379 1555 aa36,57■■■■□ 3,45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HrcG5E8J6 738 aa36,51■■■■□ 3,44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP36,19■■■■□ 3,38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NacadQ5SWP3 1504 aa36,18■■■■□ 3,38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36,16■■■■□ 3,38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim41Q5NCC3 630 aa35,89■■■■□ 3,34
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,78■■■■□ 3,32
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,71■■■■□ 3,31
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35,41■■■■□ 3,26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep164Q5DU05 1446 aa35,39■■■■□ 3,26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cngb1E1AZ71 1325 aa35,04■■■■□ 3,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chic1Q8CBW7 227 aa34,99■■■■□ 3,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34,97■■■■□ 3,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34,97■■■■□ 3,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34,91■■■■□ 3,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcgf6Q99NA9 353 aa34,84■■■■□ 3,17
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gab3Q8BSM5 595 aa34,81■■■■□ 3,16
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34,72■■■■□ 3,15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Synj1Q8CHC4 1574 aa34,71■■■■□ 3,15
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Golga3P55937 1487 aa34,68■■■■□ 3,14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BicraF8VPZ9 1578 aa34,66■■■■□ 3,14
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CftrP26361 1476 aa34,4■■■■□ 3,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34,36■■■■□ 3,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP34,31■■■■□ 3,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top2bQ64511 1612 aa34,26■■■■□ 3,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34,17■■■■□ 3,06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mier1Q5UAK0 511 aa34,07■■■■□ 3,04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34,03■■■■□ 3,04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33,95■■■■□ 3,03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zeb1Q64318 1117 aa33,92■■■■□ 3,02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NefmP08553 848 aa33,88■■■■□ 3,01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33,73■■■□□ 2,99
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmn1Q05860 1466 aa33,68■■■□□ 2,98
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33,62■■■□□ 2,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 UbtfP25976 765 aaKnown RBP33,57■■■□□ 2,97
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33,49■■■□□ 2,95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33,47■■■□□ 2,95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myt1lP97500 1187 aa33,46■■■□□ 2,95
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sall2Q9QX96 1004 aa33,44■■■□□ 2,94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neurod1Q60867 357 aa33,42■■■□□ 2,94
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npm2Q80W85 207 aa33,27■■■□□ 2,92
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP33,17■■■□□ 2,9
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33,12■■■□□ 2,89
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP33,05■■■□□ 2,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clip1Q922J3 1391 aa33,05■■■□□ 2,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TnnQ80Z71 1560 aa33,04■■■□□ 2,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP33,03■■■□□ 2,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33,02■■■□□ 2,88
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr66E9Q743 1299 aa32,99■■■□□ 2,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32,93■■■□□ 2,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32,85■■■□□ 2,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprkP35822 1457 aa32,84■■■□□ 2,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32,82■■■□□ 2,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa32,77■■■□□ 2,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32,74■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa32,73■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TonslQ6NZL6 1363 aa32,73■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il27Q8K3I6 234 aa32,72■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClspnQ80YR7 1315 aa32,71■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NrkQ9R0G8 1455 aa32,7■■■□□ 2,83
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32,68■■■□□ 2,82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arap1Q4LDD4 1452 aa32,64■■■□□ 2,82
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa32,61■■■□□ 2,81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif15Q6P9L6 1387 aa32,6■■■□□ 2,81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eea1Q8BL66 1411 aa32,59■■■□□ 2,81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anks4bQ8K3X6 423 aa32,59■■■□□ 2,81
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shroom4Q1W617 1475 aa32,54■■■□□ 2,8
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32,53■■■□□ 2,8
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,5■■■□□ 2,79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32,48■■■□□ 2,79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setd5Q5XJV7 1441 aa32,48■■■□□ 2,79
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP32,45■■■□□ 2,78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP32,42■■■□□ 2,78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32,4■■■□□ 2,78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k1P53349 1493 aa32,38■■■□□ 2,77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,35■■■□□ 2,77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32,33■■■□□ 2,77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csrnp3P59055 597 aa32,32■■■□□ 2,76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grin2bQ01097 1482 aa32,31■■■□□ 2,76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eid3Q3V124 375 aa32,3■■■□□ 2,76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tiam1Q60610 1591 aa32,27■■■□□ 2,76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32,25■■■□□ 2,75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32,2■■■□□ 2,75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Baz1bQ9Z277 1479 aa32,2■■■□□ 2,75
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd26Q811D2 1581 aa32,19■■■□□ 2,74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip1Q9QWK5 1403 aa32,16■■■□□ 2,74
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