RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spef2Q8C9J3 1734 aa33.05■■■□□ 2.88
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc5gQ8C632 165 aa32.95■■■□□ 2.87
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dip2bQ3UH60 1574 aa32.95■■■□□ 2.87
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sos1Q62245 1319 aa32.87■■■□□ 2.85
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slit3Q9WVB4 1523 aa32.85■■■□□ 2.85
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q3UJC8 639 aa32.84■■■□□ 2.85
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim27Q62158 513 aa32.84■■■□□ 2.85
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plppr3Q7TPB0 716 aa32.83■■■□□ 2.85
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cetn4Q8K4K1 168 aa32.83■■■□□ 2.85
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Astn2Q80Z10 1352 aa32.82■■■□□ 2.84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PzpQ61838 1495 aa32.82■■■□□ 2.84
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aifm3Q3TY86 605 aa32.81■■■□□ 2.84
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif24Q6NWW5 1356 aa32.8■■■□□ 2.84
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa32.76■■■□□ 2.83
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Med1Q925J9 1575 aa32.75■■■□□ 2.83
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ggnbp2Q5SV77 696 aa32.73■■■□□ 2.83
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc146E9Q9F7 977 aa32.72■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GorabQ8BRM2 368 aa32.72■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10093D3YYI8 482 aa32.71■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chl1P70232 1209 aa32.71■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf335A2A5K6 1337 aa32.69■■■□□ 2.82
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rfx1P48377 963 aa32.68■■■□□ 2.82
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa32.68■■■□□ 2.82
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Parp14Q2EMV9 1817 aa32.67■■■□□ 2.82
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Idi1P58044 227 aa32.64■■■□□ 2.82
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aldh8a1Q8BH00 487 aa32.64■■■□□ 2.82
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam13aQ8BGI4 693 aa32.64■■■□□ 2.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pik3c2aQ61194 1686 aa32.62■■■□□ 2.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgd1P52734 960 aa32.62■■■□□ 2.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tm6sf1P58749 370 aa32.62■■■□□ 2.81
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