Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56■■■■■ 6.56
Slit3Q9WVB4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
Slit3Q9WVB4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
Slit3Q9WVB4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.9■■■■■ 5.42
Slit3Q9WVB4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.53■■■■■ 5.36
Slit3Q9WVB4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
Slit3Q9WVB4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Slit3Q9WVB4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Slit3Q9WVB4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Slit3Q9WVB4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Slit3Q9WVB4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
Slit3Q9WVB4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
Slit3Q9WVB4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Slit3Q9WVB4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Slit3Q9WVB4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Slit3Q9WVB4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Slit3Q9WVB4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Slit3Q9WVB4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Slit3Q9WVB4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
Slit3Q9WVB4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Slit3Q9WVB4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Slit3Q9WVB4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Slit3Q9WVB4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Slit3Q9WVB4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Slit3Q9WVB4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Slit3Q9WVB4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Slit3Q9WVB4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Slit3Q9WVB4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Slit3Q9WVB4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Slit3Q9WVB4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Slit3Q9WVB4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Slit3Q9WVB4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Slit3Q9WVB4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Slit3Q9WVB4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Slit3Q9WVB4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
Slit3Q9WVB4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
Slit3Q9WVB4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Slit3Q9WVB4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Slit3Q9WVB4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Slit3Q9WVB4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Slit3Q9WVB4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Slit3Q9WVB4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Slit3Q9WVB4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Slit3Q9WVB4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Slit3Q9WVB4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Slit3Q9WVB4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Slit3Q9WVB4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Slit3Q9WVB4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Slit3Q9WVB4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Slit3Q9WVB4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Slit3Q9WVB4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Slit3Q9WVB4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Slit3Q9WVB4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Slit3Q9WVB4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
Slit3Q9WVB4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Slit3Q9WVB4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Slit3Q9WVB4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Slit3Q9WVB4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Slit3Q9WVB4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Slit3Q9WVB4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Slit3Q9WVB4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Slit3Q9WVB4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Slit3Q9WVB4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Slit3Q9WVB4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Slit3Q9WVB4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Slit3Q9WVB4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Slit3Q9WVB4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Slit3Q9WVB4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Slit3Q9WVB4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Slit3Q9WVB4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Slit3Q9WVB4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Slit3Q9WVB4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Slit3Q9WVB4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Slit3Q9WVB4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Slit3Q9WVB4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Slit3Q9WVB4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Slit3Q9WVB4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Slit3Q9WVB4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Slit3Q9WVB4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Slit3Q9WVB4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Slit3Q9WVB4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Slit3Q9WVB4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Slit3Q9WVB4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Slit3Q9WVB4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Slit3Q9WVB4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Slit3Q9WVB4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Slit3Q9WVB4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Slit3Q9WVB4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Slit3Q9WVB4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Slit3Q9WVB4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Slit3Q9WVB4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Slit3Q9WVB4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Slit3Q9WVB4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Slit3Q9WVB4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Slit3Q9WVB4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Slit3Q9WVB4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Slit3Q9WVB4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
Slit3Q9WVB4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Slit3Q9WVB4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Slit3Q9WVB4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms