Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
PrkcshO08795 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
PrkcshO08795 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
PrkcshO08795 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,65■■■■□ 3,62
PrkcshO08795 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
PrkcshO08795 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
PrkcshO08795 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
PrkcshO08795 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
PrkcshO08795 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
PrkcshO08795 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,84■■■■□ 3,49
PrkcshO08795 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
PrkcshO08795 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
PrkcshO08795 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
PrkcshO08795 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
PrkcshO08795 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
PrkcshO08795 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
PrkcshO08795 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
PrkcshO08795 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,83■■■■□ 3,33
PrkcshO08795 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
PrkcshO08795 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
PrkcshO08795 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
PrkcshO08795 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
PrkcshO08795 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
PrkcshO08795 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
PrkcshO08795 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
PrkcshO08795 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
PrkcshO08795 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
PrkcshO08795 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
PrkcshO08795 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
PrkcshO08795 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
PrkcshO08795 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
PrkcshO08795 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34,79■■■■□ 3,16
PrkcshO08795 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
PrkcshO08795 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
PrkcshO08795 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
PrkcshO08795 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
PrkcshO08795 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
PrkcshO08795 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
PrkcshO08795 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
PrkcshO08795 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
PrkcshO08795 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
PrkcshO08795 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
PrkcshO08795 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
PrkcshO08795 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
PrkcshO08795 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
PrkcshO08795 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
PrkcshO08795 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
PrkcshO08795 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
PrkcshO08795 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
PrkcshO08795 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
PrkcshO08795 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
PrkcshO08795 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
PrkcshO08795 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
PrkcshO08795 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
PrkcshO08795 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
PrkcshO08795 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
PrkcshO08795 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
PrkcshO08795 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
PrkcshO08795 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
PrkcshO08795 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
PrkcshO08795 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
PrkcshO08795 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
PrkcshO08795 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
PrkcshO08795 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,88
PrkcshO08795 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
PrkcshO08795 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
PrkcshO08795 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
PrkcshO08795 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
PrkcshO08795 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
PrkcshO08795 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
PrkcshO08795 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
PrkcshO08795 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
PrkcshO08795 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
PrkcshO08795 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
PrkcshO08795 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
PrkcshO08795 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
PrkcshO08795 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32,68■■■□□ 2,82
PrkcshO08795 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
PrkcshO08795 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
PrkcshO08795 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
PrkcshO08795 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
PrkcshO08795 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
PrkcshO08795 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
PrkcshO08795 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
PrkcshO08795 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
PrkcshO08795 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
PrkcshO08795 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
PrkcshO08795 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
PrkcshO08795 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
PrkcshO08795 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
PrkcshO08795 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
PrkcshO08795 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
PrkcshO08795 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
PrkcshO08795 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
PrkcshO08795 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms