Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9B3

Spryd3, SPRY domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spryd3E9Q9B3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Spryd3E9Q9B3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Spryd3E9Q9B3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Spryd3E9Q9B3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Spryd3E9Q9B3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Spryd3E9Q9B3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Spryd3E9Q9B3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Spryd3E9Q9B3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Spryd3E9Q9B3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Spryd3E9Q9B3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Spryd3E9Q9B3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Spryd3E9Q9B3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Spryd3E9Q9B3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Spryd3E9Q9B3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Spryd3E9Q9B3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Spryd3E9Q9B3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Spryd3E9Q9B3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Spryd3E9Q9B3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Spryd3E9Q9B3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Spryd3E9Q9B3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Spryd3E9Q9B3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Spryd3E9Q9B3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Spryd3E9Q9B3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Spryd3E9Q9B3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Spryd3E9Q9B3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Spryd3E9Q9B3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Spryd3E9Q9B3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Spryd3E9Q9B3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Spryd3E9Q9B3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Spryd3E9Q9B3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Spryd3E9Q9B3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Spryd3E9Q9B3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Spryd3E9Q9B3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Spryd3E9Q9B3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Spryd3E9Q9B3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Spryd3E9Q9B3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Spryd3E9Q9B3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Spryd3E9Q9B3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Spryd3E9Q9B3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Spryd3E9Q9B3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Spryd3E9Q9B3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Spryd3E9Q9B3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Spryd3E9Q9B3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Spryd3E9Q9B3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Spryd3E9Q9B3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Spryd3E9Q9B3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Spryd3E9Q9B3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Spryd3E9Q9B3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Spryd3E9Q9B3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Spryd3E9Q9B3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Spryd3E9Q9B3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Spryd3E9Q9B3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Spryd3E9Q9B3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Spryd3E9Q9B3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Spryd3E9Q9B3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Spryd3E9Q9B3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Spryd3E9Q9B3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Spryd3E9Q9B3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Spryd3E9Q9B3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Spryd3E9Q9B3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Spryd3E9Q9B3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Spryd3E9Q9B3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Spryd3E9Q9B3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Spryd3E9Q9B3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Spryd3E9Q9B3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Spryd3E9Q9B3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Spryd3E9Q9B3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Spryd3E9Q9B3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Spryd3E9Q9B3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Spryd3E9Q9B3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Spryd3E9Q9B3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spryd3E9Q9B3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Spryd3E9Q9B3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Spryd3E9Q9B3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Spryd3E9Q9B3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Spryd3E9Q9B3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Spryd3E9Q9B3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Spryd3E9Q9B3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Spryd3E9Q9B3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Spryd3E9Q9B3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spryd3E9Q9B3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Spryd3E9Q9B3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Spryd3E9Q9B3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Spryd3E9Q9B3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Spryd3E9Q9B3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Spryd3E9Q9B3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Spryd3E9Q9B3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Spryd3E9Q9B3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Spryd3E9Q9B3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Spryd3E9Q9B3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Spryd3E9Q9B3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Spryd3E9Q9B3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Spryd3E9Q9B3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Spryd3E9Q9B3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Spryd3E9Q9B3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Spryd3E9Q9B3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Spryd3E9Q9B3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Spryd3E9Q9B3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Spryd3E9Q9B3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Spryd3E9Q9B3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms