Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,1■■■■■ 4,97
Irx3P81067 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Irx3P81067 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Irx3P81067 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Irx3P81067 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Irx3P81067 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,93■■■■□ 3,98
Irx3P81067 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Irx3P81067 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Irx3P81067 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,95■■■■□ 3,83
Irx3P81067 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Irx3P81067 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Irx3P81067 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Irx3P81067 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,44■■■■□ 3,74
Irx3P81067 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Irx3P81067 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Irx3P81067 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
Irx3P81067 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Irx3P81067 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Irx3P81067 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Irx3P81067 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Irx3P81067 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Irx3P81067 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Irx3P81067 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Irx3P81067 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Irx3P81067 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Irx3P81067 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Irx3P81067 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Irx3P81067 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Irx3P81067 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Irx3P81067 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,49■■■■□ 3,43
Irx3P81067 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Irx3P81067 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Irx3P81067 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Irx3P81067 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Irx3P81067 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Irx3P81067 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Irx3P81067 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Irx3P81067 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Irx3P81067 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Irx3P81067 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Irx3P81067 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Irx3P81067 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Irx3P81067 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Irx3P81067 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Irx3P81067 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Irx3P81067 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Irx3P81067 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Irx3P81067 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Irx3P81067 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Irx3P81067 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Irx3P81067 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Irx3P81067 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Irx3P81067 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Irx3P81067 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Irx3P81067 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,32■■■■□ 3,25
Irx3P81067 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Irx3P81067 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Irx3P81067 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,15■■■■□ 3,22
Irx3P81067 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Irx3P81067 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Irx3P81067 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Irx3P81067 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Irx3P81067 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Irx3P81067 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Irx3P81067 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Irx3P81067 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
Irx3P81067 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Irx3P81067 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Irx3P81067 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Irx3P81067 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Irx3P81067 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Irx3P81067 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Irx3P81067 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,56■■■■□ 3,12
Irx3P81067 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Irx3P81067 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Irx3P81067 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Irx3P81067 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Irx3P81067 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Irx3P81067 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Irx3P81067 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Irx3P81067 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Irx3P81067 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Irx3P81067 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Irx3P81067 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Irx3P81067 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Irx3P81067 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Irx3P81067 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Irx3P81067 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Irx3P81067 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Irx3P81067 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Irx3P81067 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Irx3P81067 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Irx3P81067 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Irx3P81067 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Irx3P81067 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Irx3P81067 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Irx3P81067 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Irx3P81067 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Irx3P81067 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Irx3P81067 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms