RNA–Protein interactions for RNA: YOR027W

STI1, Transcript of Hsp90 cochaperone, yeast

Gene STI1, Length 1,770 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STI1	YOR027W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	RPB10	P22139	70 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	PPX1	P38698	397 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	APC11	Q12157	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	FRT1	Q99332	602 aa		4.72	□□□□□ -1.65
STI1	YOR027W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	QDR2	P40474	542 aa		4.71	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MTO1	P53070	669 aa		4.71	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.71	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	KAP122	P32767	1081 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	SLA1	P32790	1244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YAP3	P38749	330 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	DYS1	P38791	387 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	FIR1	P40020	876 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	HXT8	P40886	569 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	VTC4	P47075	721 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	UFD2	P54860	961 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	ASF1	P32447	279 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	POL32	P47110	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	WHI5	Q12416	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	SMC1	P32908	1225 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	OPT2	Q06593	877 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MYO4	P32492	1471 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	PSH1	Q12161	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	BUD3	P25558	1636 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MSN1	P22148	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YBR287W	P38355	427 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MET10	P39692	1035 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	UBP15	P50101	1230 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	YNL011C	P53980	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MET4	P32389	672 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	KTR2	P33550	425 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MGE1	P38523	228 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	OSH7	P38755	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	RAD55	P38953	406 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	ATE1	P16639	503 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	ISW1	P38144	1129 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	GIP1	P38229	639 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	ALD2	P47771	506 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	SCW11	P53189	542 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	MNL2	Q12205	849 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.65	□□□□□ -1.66
STI1	YOR027W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RGP1	P16664	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	MRPL16	P38064	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	ACO2	P39533	789 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	NTA1	P40354	457 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RGD2	P43556	714 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	CDC55	Q00362	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RPC31	P17890	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	BSD2	P38356	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	SAM37	P50110	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	CAF120	P53836	1060 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	YOR1	P53049	1477 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	STU1	P38198	1513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
STI1	YOR027W	SEC8	P32855	1065 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	PSY2	P40164	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RSC4	Q02206	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	STB3	Q12427	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	APM2	P38700	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	AIM46	P38885	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	BSC2	Q05611	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	TSC11	P40061	1430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	SKP1	P52286	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	VTH1	P40438	1549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	VTH2	P40890	1549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	VPS35	P34110	944 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	DAK2	P43550	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	OXR1	Q08952	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STI1	YOR027W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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