RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	YKE2	P52553	114 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	FPK1	P53739	893 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	ECM23	Q02710	187 aa		12.63	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	BIK1	P11709	440 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	TTI1	P36097	1038 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	YHL017W	P38745	532 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	BDH2	P39713	417 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	VID28	P40547	921 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	UFD2	P54860	961 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	EST2	Q06163	884 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	FLO1	P32768	1537 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	GSC2	P40989	1895 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	YJL171C	P46992	396 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	FLO11	P08640	1367 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	MPH3	P0CE00	602 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	MYO3	P36006	1272 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	CTF18	P49956	741 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	NSG2	P53898	299 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	HRQ1	Q05549	1077 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	PCL8	Q08966	492 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	RAD61	Q99359	647 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDR2	YOL052C-A	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	MSP1	P28737	362 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	ANP1	P32629	500 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	DJP1	P40564	432 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	HST1	P53685	503 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	AAD16	Q02895	342 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	ELG1	Q12050	791 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	GLC3	P32775	704 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	YHL050C	P38721	697 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	PEX14	P53112	341 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	YLR407W	Q06070	228 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	YPL150W	Q12152	901 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	ROX1	P25042	368 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	ALG2	P43636	503 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	HAP5	Q02516	242 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	COG8	Q04632	607 aa		12.56	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	VID27	P40157	782 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	TFC6	Q06339	672 aa		12.55	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.54	□□□□□ -0.4	not detected
DDR2	YOL052C-A	MAK31	P23059	88 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	BUD6	P41697	788 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	MTC3	P53077	123 aa		12.54	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	SLI15	P38283	698 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	PES4	P39684	611 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	YGR117C	P53270	476 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	TIM50	Q02776	476 aa		12.53	□□□□□ -0.4
DDR2	YOL052C-A	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	CBP3	P21560	335 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RIT1	P23796	513 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	MAL31	P38156	614 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	HDA1	P53973	706 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ISW2	Q08773	1120 aa		12.52	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PRE8	P23639	250 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	AKR1	P39010	764 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	VPS8	P39702	1274 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	KIN1	P13185	1064 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	FET4	P40988	552 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	EPL1	P43572	832 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ENT3	P47160	408 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	VPS4	P52917	437 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	YGL081W	P53156	320 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	KEX1	P09620	729 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	SRM1	P21827	482 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ELM1	P32801	640 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	STV1	P37296	890 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	MAL33	P38157	468 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RFC5	P38251	354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	CIR1	P42940	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	SKG3	Q06315	1026 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	AIM44	Q99299	758 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	CLC1	P17891	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ADP1	P25371	1049 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PEX19	Q07418	342 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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