RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	QDR1	P40475	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	RSC6	P25632	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RIO2	YNL207W	TFA2	P36145	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	AIM46	P38885	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	RAD55	P38953	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	FIR1	P40020	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	ALD3	P54114	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	RSC2	Q06488	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	CHS2	P14180	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	SMC1	P32908	1225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	PSY2	P40164	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	YJL181W	P46987	611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	ERP5	P38819	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	ACF4	P47129	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	MNL2	Q12205	849 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	SLP1	Q12232	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	FUS1	P11710	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	SAF1	P38352	637 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	YBR287W	P38355	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	MDJ2	P42834	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	YGR130C	P53278	816 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	CTR9	P89105	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	SOG2	Q08817	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	COB	P00163	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	GIP2	P40036	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	TED1	P40533	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	UFD2	P54860	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	RSC4	Q02206	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	HAT1	Q12341	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIO2	YNL207W	UBP5	P39944	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	CTH1	P47976	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	FRT1	Q99332	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	GLO4	Q12320	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	DUR3	P33413	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	GUP1	P53154	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	NUT2	Q06213	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	PAN5	P38787	379 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	AKR1	P39010	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	YJR124C	P47159	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	CYC7	P00045	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	RIM11	P38615	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	LEM3	P42838	414 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	YNL011C	P53980	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	CDC55	Q00362	526 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RIO2	YNL207W	YKL222C	P35995	705 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	RNQ1	P25367	405 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	SPO74	P45819	413 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	DSE4	P53753	1117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	FLP1	P03870	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	NEO1	P40527	1151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	SAP155	P43612	1002 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	BSC2	Q05611	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
RIO2	YNL207W	NPR1	P22211	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	YHL050C	P38721	697 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	YHR219W	P38900	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	FET4	P40988	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	ELG1	Q12050	791 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	REC8	Q12188	680 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	ERS1	P17261	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	NCE103	P53615	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	YHL008C	P38750	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RIO2	YNL207W	MET4	P32389	672 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	NUT1	P53114	1132 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	WHI5	Q12416	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RIO2	YNL207W	PPX1	P38698	397 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.1 ms