RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	COG8	Q04632	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	GGA1	Q06336	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RRN11	YML043C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	RAD2	P07276	1031 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	CLN1	P20437	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	GUT2	P32191	649 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RRN11	YML043C	TPM2	P40414	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	RNT1	Q02555	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	NDL1	Q06568	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	FRA1	Q07825	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	HAP4	P14064	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	DAL1	P32375	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	SWH1	P35845	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	YHL050C	P38721	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	YHR219W	P38900	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	YFL066C	P43538	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	ITC1	P53125	1264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	NSG2	P53898	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	CUZ1	P53899	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	MDM38	Q08179	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	TAF2	P23255	1407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	RAD3	P06839	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	DAL5	P15365	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	KAR3	P17119	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	PIM1	P36775	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	ISW1	P38144	1129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	TCD1	P38756	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	MDJ2	P42834	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	ALD2	P47771	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	ISU1	Q03020	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	SIN3	P22579	1536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN11	YML043C	DNA2	P38859	1522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	AI1	P03875	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	TAF13	P11747	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PSO2	P30620	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PUP2	P32379	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SOH1	P38633	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PPX1	P38698	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	POL32	P47110	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	TPO2	P53283	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	YNL050C	P53952	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RCF1	Q03713	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GCN2	P15442	1659 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	APL6	P46682	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ROM1	P53046	1155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ATG1	P53104	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PNP1	Q05788	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ATG20	Q07528	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SEC39	Q12745	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	VPS5	Q92331	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	BOL3	P39724	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	IAH1	P41734	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GAS4	Q08271	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	THI72	Q08579	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RAD9	P14737	1309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SRS2	P12954	1174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ATE1	P16639	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	NPR3	P38742	1146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	CEM1	P39525	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	THI12	P42883	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	THI5	P43534	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	THI11	P47183	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	ARR1	Q06596	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PUN1	Q06991	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	THI13	Q07748	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	PSR1	Q07800	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SLP1	Q12232	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	WHI5	Q12416	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	HSL1	P34244	1518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RAD16	P31244	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	SVF1	Q05515	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	GLE1	Q12315	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	TSC13	Q99190	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	VAN1	P23642	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN11	YML043C	NDC80	P40460	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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