RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W BOI2P39969 1040 aa5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W SNU71P53207 620 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W PDR10P51533 1564 aa5.72□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W YTA6P40328 754 aa5.72□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W PDR12Q02785 1511 aa5.72□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W YTA7P40340 1379 aa5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W HAP4P14064 554 aa5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W TTI1P36097 1038 aa5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W MTO1P53070 669 aa5.7□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W TOP1P04786 769 aa5.69□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W GAL2P13181 574 aa5.69□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W ROM1P53046 1155 aa5.69□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W TGL4P36165 910 aa5.68□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W GAS4Q08271 471 aa5.68□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W YDR215CQ12240 137 aa5.68□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W GDB1Q06625 1536 aa5.68□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W ECM23Q02710 187 aa5.67□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W MCA1Q08601 432 aa5.67□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W SIS2P36024 562 aa5.66□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W UBP1P25037 809 aa5.65□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W MET1P36150 593 aa5.65□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W HXT5P38695 592 aa5.65□□□□□ -1.5
PIR3YKL163W BUD3P25558 1636 aa5.65□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W SBP1P10080 294 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W CPS1P27614 576 aa5.64□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W PRY1P47032 299 aa5.64□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W YAP3P38749 330 aa5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W PRK1P40494 810 aa5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W YNR040WP53736 256 aa5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W URN1Q06525 465 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W KAP122P32767 1081 aa5.62□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.62□□□□□ -1.51not detected
PIR3YKL163W DNF3Q12674 1656 aa5.62□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W VAN1P23642 535 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W SUV3P32580 737 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W SCD5P34758 872 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W UBX7P38349 436 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W SKP1P52286 194 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W MAK10Q02197 733 aa5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W HEM3P28789 327 aa5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W TAT1P38085 619 aa5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W ALG14P38242 237 aa5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W QDR2P40474 542 aa5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W HEH2Q03281 663 aa5.6□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W PUP1P25043 261 aa5.59□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.59□□□□□ -1.51not detected
PIR3YKL163W LSB6P42951 607 aa5.59□□□□□ -1.51
PIR3YKL163W RPC31P17890 251 aa5.58□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W NHA1Q99271 985 aa5.58□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W BNR1P40450 1375 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W MLP2P40457 1679 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W MRP10O75012 95 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W CDC3P32457 520 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W PAM1P37304 830 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W BRN1P38170 754 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W APM2P38700 605 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W CWH41P53008 833 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W CAB1Q04430 367 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W TRS33Q99394 268 aa5.57□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W RRN6P32786 894 aa5.56□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W TY3B-GQ99315 1547 aa5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W BUD9P53226 547 aa5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W GIS4Q04233 774 aa5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W YML083CQ04526 418 aa5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W GAS5Q08193 484 aa5.55□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W VMA3P25515 160 aa5.54□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W YBR197CP38306 217 aa5.54□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W MRPL33P20084 86 aa5.53□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W ITC1P53125 1264 aa5.53□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W YPL034WQ03083 165 aa5.53□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W YSP2Q06681 1438 aa5.53□□□□□ -1.52
PIR3YKL163W IDI1P15496 288 aa5.52□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W BSD2P38356 321 aa5.52□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W ASF1P32447 279 aa5.51□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W DOS2P54858 310 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.4 ms