RNA–Protein interactions for RNA: YJR079W

YJR079W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YJR079W, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR079W	YJR079W	RRN6	P32786	894 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR079W	YJR079W	TOS1	P38288	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR079W	YJR079W	NTA1	P40354	457 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR079W	YJR079W	ALD3	P54114	506 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YJR079W	YJR079W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
YJR079W	YJR079W	TFA2	P36145	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	RGD2	P43556	714 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	SPO74	P45819	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	LIP5	P32875	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	KTR2	P33550	425 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	AKR1	P39010	764 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	CTH1	P47976	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	YGR130C	P53278	816 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	PNP1	Q05788	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	AVT1	P47082	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	NCE103	P53615	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	AOS1	Q06624	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	RLF2	Q12495	606 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	ELM1	P32801	640 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	YML083C	Q04526	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	ELG1	Q12050	791 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	CYC7	P00045	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	SMC1	P32908	1225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	RAD55	P38953	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YJR079W	YJR079W	PSY2	P40164	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	YJR124C	P47159	448 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	GLO4	Q12320	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	NEO1	P40527	1151 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	FAR11	P53917	953 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	RPB10	P22139	70 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	GIC2	Q06648	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	ERS1	P17261	260 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	FET4	P40988	552 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YJR079W	YJR079W	BOL3	P39724	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	TAF7	Q05021	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	NIT1	P40447	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	MMM1	P41800	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	CIT3	P43635	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	GCV1	P48015	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	ECL1	P48235	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	UFD2	P54860	961 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	CTR9	P89105	1077 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	RSC4	Q02206	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	NSI1	Q12457	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	RIM11	P38615	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	UBP5	P39944	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	YIG1	Q08956	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	GPT2	P36148	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	SEA4	P38164	1038 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	SDH1	Q00711	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	NPR1	P22211	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	LRG1	P35688	1017 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	MEC3	Q02574	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	DFG16	Q99234	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJR079W	YJR079W	COB	P00163	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	RNQ1	P25367	405 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	SEG2	P34250	1132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	RCM1	P53972	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	QDR1	P40475	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	ACF4	P47129	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	ATG1	P53104	897 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	ORC3	P54790	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	SAP155	P43612	1002 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	ALT1	P52893	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJR079W	YJR079W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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