RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W RAD61Q99359 647 aa4.83□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RRP8P38961 392 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W GSM1P42950 618 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W CBP1P07252 654 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RPC31P17890 251 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RAD53P22216 821 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SIS2P36024 562 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W OPY1P38271 328 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W VHR2P40041 505 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YIL089WP40500 205 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ALG2P43636 503 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SKG3Q06315 1026 aa4.82□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ADP1P25371 1049 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W DLD1P32891 587 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RPT3P33298 428 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W CST26P38226 397 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PPM2Q08282 695 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PRE8P23639 250 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PER1P25625 357 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W BRN1P38170 754 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W VPS4P52917 437 aa4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ERG12P07277 443 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W COQ1P18900 473 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PIB2P53191 635 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SOL4P53315 255 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W FAR11P53917 953 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W TUS1Q06412 1307 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RNR2P09938 399 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SRM1P21827 482 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PEP3P27801 918 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ASF1P32447 279 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W STV1P37296 890 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RSC30P38781 883 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YAF9P53930 226 aa4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W MYO3P36006 1272 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W CST9Q06032 482 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PSK2Q08217 1101 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W GSC2P40989 1895 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W HVG1P0CE11 249 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YBL028CP38202 106 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W VAB2P40003 282 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W NET1P47035 1189 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RMD1Q03441 430 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SRF1Q12516 437 aa4.79□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W DIT2P21595 489 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W OCT1P35999 772 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W AIM9P40053 627 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W LYS14P40971 790 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W UFD2P54860 961 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W GIN4Q12263 1142 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ANP1P32629 500 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W RER2P35196 286 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
SPC105YGL093W TOM71P38825 639 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W ECM23Q02710 187 aa4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SPC105YGL093W YHL050CP38721 697 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W EST2Q06163 884 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W YKR018CP36114 725 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W YHL017WP38745 532 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W VID27P40157 782 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W NSG2P53898 299 aa4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W ETP1P38748 585 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W VPS8P39702 1274 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W HXT13P39924 564 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W RBA50Q04418 439 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W ISW2Q08773 1120 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W MATALPHA2P0CY08 210 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W HMLALPHA2P0CY09 210 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W MAK31P23059 88 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W BMH2P34730 273 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W TTI1P36097 1038 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W MAL31P38156 614 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W ACA1P39970 489 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W YKE2P52553 114 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W TY3A-GQ12173 290 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W TY3A-IQ99219 290 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W CBP3P21560 335 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W HXT17P53631 564 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W FOL1P53848 824 aa4.76□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W TRL1P09880 827 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W FBP26P32604 452 aa4.75□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W PTK2P47116 818 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SPC105YGL093W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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