RNA–Protein interactions for RNA: YGL058W

RAD6, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme (E2), yeast

Gene RAD6, Length 519 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD6	YGL058W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	COQ2	P32378	372 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	KAP122	P32767	1081 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	KAE1	P36132	386 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	LDH1	P38139	375 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	IPL1	P38991	367 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	HXT8	P40886	569 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	YNR040W	P53736	256 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	TOS1	P38288	455 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	WHI5	Q12416	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	MSN1	P22148	382 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
RAD6	YGL058W	BSD2	P38356	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	MNL2	Q12205	849 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	LIP5	P32875	414 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	SMC1	P32908	1225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	GIP1	P38229	639 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	NTA1	P40354	457 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAD6	YGL058W	IDI1	P15496	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	HEM3	P28789	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
RAD6	YGL058W	ISW1	P38144	1129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	APM2	P38700	605 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RAD55	P38953	406 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RGD2	P43556	714 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	MET4	P32389	672 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	SAF1	P38352	637 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	ITC1	P53125	1264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	CDC55	Q00362	526 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RSC6	P25632	483 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	FIR1	P40020	876 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	PSY2	P40164	858 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	YGR130C	P53278	816 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RSC4	Q02206	625 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	SLP1	Q12232	587 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	ASF1	P32447	279 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	THI12	P42883	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	THI5	P43534	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	THI11	P47183	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	THI13	Q07748	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	YBR287W	P38355	427 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	YIL165C	P40446	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	YNL011C	P53980	444 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	BSC2	Q05611	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
RAD6	YGL058W	ATE1	P16639	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	AIM46	P38885	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	TED1	P40533	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	POL32	P47110	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	CHS2	P14180	963 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	SEA4	P38164	1038 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	AKR1	P39010	764 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	REC8	Q12188	680 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RAD6	YGL058W	RNQ1	P25367	405 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	UBP5	P39944	805 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	SPO74	P45819	413 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	YJR107W	P47145	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	SAM37	P50110	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	PPT1	P53043	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	CTR9	P89105	1077 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	RSC2	Q06488	889 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	CYC7	P00045	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	COB	P00163	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	GIP2	P40036	548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	DAK2	P43550	591 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	FLP1	P03870	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	FUS1	P11710	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	VPS35	P34110	944 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	MGE1	P38523	228 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	YHL008C	P38750	627 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	FYV10	P40492	516 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	ALD3	P54114	506 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	TOS4	Q06266	489 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RAD6	YGL058W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.03	□□□□□ -1.76

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