RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113343.7

Cldn34c1-201, Transcript of Claudin 34C1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn34c1, Length 3,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tmco5bQ80X59 307 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Plin1Q8CGN5 517 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Iqsec2Q5DU25 1478 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Znf521Q6KAS7 1311 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Txndc2Q6P902 515 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 PalmQ9Z0P4 383 aa17■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Psme1P97371 249 aa16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nutm1Q8BHP2 1126 aa16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Zmym3Q9JLM4 1370 aa16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 FanciQ8K368 1330 aa16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nectin2P32507 530 aa16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Fam135bQ9DAI6 1403 aa16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 CastP51125 788 aa16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mre11Q61216 706 aa16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rsph4aQ8BYM7 716 aa16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Swt1Q9DBQ9 907 aa16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Nrxn1Q9CS84 1514 aa16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ttc37F8VPK0 1563 aa16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 PtprmP28828 1452 aa16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ciz1Q8VEH2 845 aa16.94■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Adgrl3Q80TS3 1537 aa16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cul9Q80TT8 1865 aa16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Pnmal2G3X9N3 661 aa16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Kiaa0556Q8C753 1610 aa16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Adamts7Q68SA9 1657 aa16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Synj2Q9D2G5 1434 aa16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ift172Q6VH22 1749 aa16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 AampJ3QN89 436 aa16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Map3k19E9Q3S4 1311 aa16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Qser1A2BIE1 1698 aa16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 NgefQ8CHT1 710 aa16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ankrd50F7BE84 1390 aa16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Naip7Q9JIB3 1402 aa16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Atl3Q91YH5 541 aa16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Mcm10Q0VBD2 885 aa16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Adgrl1Q80TR1 1466 aa16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 AU019823E9PUQ3 292 aa16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Fchsd2Q3USJ8 740 aa16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Q4VA45 678 aa16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cabp2Q9JLK4 216 aa16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Trim28Q62318 834 aa16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 PaskQ8CEE6 1383 aa16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ppp1r15aP17564 657 aa16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Map7O88735 730 aa16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Usp16Q99LG0 825 aa16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 NpatQ8BMA5 1420 aa16.83■□□□□ 0.29
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Q3UPC7 1272 aa16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tmc1Q8R4P5 757 aa16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Hecw2Q6I6G8 1578 aa16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gnai1B2RSH2 354 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Kif18aQ91WD7 886 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Gnai3Q9DC51 354 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Abca14E9Q8F8 1683 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Arhgef28P97433 1693 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Plekhg1F6S200 1446 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 SkilQ60665 675 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Idi2Q8BFZ6 227 aa16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Vamp4O70480 141 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Kif13aQ9EQW7 1749 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Sptbn5F6UCX4 1208 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rabep1O35551 862 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Aplp1Q03157 653 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Pibf1E9Q6K3 756 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 MpripP97434 1024 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Cog6Q8R3I3 657 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Klhdc4Q921I2 584 aa16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Sox12Q04890 314 aa16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Rsph6aQ8CDR2 708 aa16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Pik3r4Q8VD65 1358 aa16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Htatsf1Q8BGC0 757 aa16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 Stk31Q99MW1 1018 aa16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 NktrP30415 1453 aa16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.4 ms