Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59,79■■■■■ 7,16
Cul9Q80TT8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55,97■■■■■ 6,55
Cul9Q80TT8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,39■■■■■ 6,3
Cul9Q80TT8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52,49■■■■■ 5,99
Cul9Q80TT8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51,55■■■■■ 5,84
Cul9Q80TT8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50,74■■■■■ 5,71
Cul9Q80TT8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,66■■■■■ 5,7
Cul9Q80TT8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,59■■■■■ 5,69
Cul9Q80TT8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50,23■■■■■ 5,63
Cul9Q80TT8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,23■■■■■ 5,63
Cul9Q80TT8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49,67■■■■■ 5,54
Cul9Q80TT8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49,07■■■■■ 5,45
Cul9Q80TT8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48,43■■■■■ 5,34
Cul9Q80TT8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,35■■■■■ 5,33
Cul9Q80TT8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,31■■■■■ 5,32
Cul9Q80TT8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Cul9Q80TT8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,8■■■■■ 5,24
Cul9Q80TT8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,8■■■■■ 5,24
Cul9Q80TT8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,48■■■■■ 5,19
Cul9Q80TT8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47,42■■■■■ 5,18
Cul9Q80TT8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47,4■■■■■ 5,18
Cul9Q80TT8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47,27■■■■■ 5,16
Cul9Q80TT8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,14■■■■■ 5,14
Cul9Q80TT8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,51■■■■■ 5,04
Cul9Q80TT8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46,51■■■■■ 5,04
Cul9Q80TT8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46,5■■■■■ 5,03
Cul9Q80TT8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,42■■■■■ 5,02
Cul9Q80TT8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,09■■■■■ 4,97
Cul9Q80TT8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,97■■■■■ 4,95
Cul9Q80TT8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45,93■■■■■ 4,94
Cul9Q80TT8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,79■■■■■ 4,92
Cul9Q80TT8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,76■■■■■ 4,92
Cul9Q80TT8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45,73■■■■■ 4,91
Cul9Q80TT8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45,7■■■■■ 4,91
Cul9Q80TT8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,51■■■■■ 4,88
Cul9Q80TT8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
Cul9Q80TT8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
Cul9Q80TT8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45,44■■■■■ 4,87
Cul9Q80TT8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45,4■■■■■ 4,86
Cul9Q80TT8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,18■■■■■ 4,82
Cul9Q80TT8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45,13■■■■■ 4,82
Cul9Q80TT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45,11■■■■■ 4,81
Cul9Q80TT8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45,08■■■■■ 4,81
Cul9Q80TT8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Cul9Q80TT8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45,01■■■■■ 4,8
Cul9Q80TT8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,88■■■■■ 4,78
Cul9Q80TT8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44,87■■■■■ 4,77
Cul9Q80TT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44,81■■■■■ 4,76
Cul9Q80TT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44,81■■■■■ 4,76
Cul9Q80TT8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44,64■■■■■ 4,74
Cul9Q80TT8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44,57■■■■■ 4,73
Cul9Q80TT8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,48■■■■■ 4,71
Cul9Q80TT8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44,45■■■■■ 4,71
Cul9Q80TT8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,38■■■■■ 4,7
Cul9Q80TT8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
Cul9Q80TT8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,33■■■■■ 4,69
Cul9Q80TT8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44,32■■■■■ 4,68
Cul9Q80TT8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Cul9Q80TT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44,2■■■■■ 4,67
Cul9Q80TT8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,09■■■■■ 4,65
Cul9Q80TT8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,01■■■■■ 4,64
Cul9Q80TT8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43,97■■■■■ 4,63
Cul9Q80TT8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,95■■■■■ 4,63
Cul9Q80TT8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,63
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43,86■■■■■ 4,61
Cul9Q80TT8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43,75■■■■■ 4,59
Cul9Q80TT8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Cul9Q80TT8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Cul9Q80TT8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43,49■■■■■ 4,55
Cul9Q80TT8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
Cul9Q80TT8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43,42■■■■■ 4,54
Cul9Q80TT8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
Cul9Q80TT8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Cul9Q80TT8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43,27■■■■■ 4,52
Cul9Q80TT8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Cul9Q80TT8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Cul9Q80TT8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Cul9Q80TT8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Cul9Q80TT8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43,05■■■■■ 4,48
Cul9Q80TT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42,99■■■■■ 4,47
Cul9Q80TT8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,95■■■■■ 4,47
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42,93■■■■■ 4,46
Cul9Q80TT8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42,93■■■■■ 4,46
Cul9Q80TT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Cul9Q80TT8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Cul9Q80TT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Cul9Q80TT8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Cul9Q80TT8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Cul9Q80TT8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42,75■■■■■ 4,43
Cul9Q80TT8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Cul9Q80TT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Cul9Q80TT8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,64■■■■■ 4,42
Cul9Q80TT8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Cul9Q80TT8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Cul9Q80TT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Cul9Q80TT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
Cul9Q80TT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Cul9Q80TT8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42,49■■■■■ 4,39
Cul9Q80TT8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Cul9Q80TT8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,45■■■■■ 4,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,6 ms