Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.79■■■■■ 7.16
Cul9Q80TT8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
Cul9Q80TT8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
Cul9Q80TT8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.49■■■■■ 5.99
Cul9Q80TT8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.55■■■■■ 5.84
Cul9Q80TT8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.74■■■■■ 5.71
Cul9Q80TT8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
Cul9Q80TT8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
Cul9Q80TT8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Cul9Q80TT8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Cul9Q80TT8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
Cul9Q80TT8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.07■■■■■ 5.45
Cul9Q80TT8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Cul9Q80TT8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
Cul9Q80TT8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Cul9Q80TT8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Cul9Q80TT8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Cul9Q80TT8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Cul9Q80TT8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Cul9Q80TT8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Cul9Q80TT8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
Cul9Q80TT8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Cul9Q80TT8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
Cul9Q80TT8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Cul9Q80TT8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Cul9Q80TT8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Cul9Q80TT8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Cul9Q80TT8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Cul9Q80TT8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Cul9Q80TT8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
Cul9Q80TT8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Cul9Q80TT8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Cul9Q80TT8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Cul9Q80TT8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Cul9Q80TT8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Cul9Q80TT8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Cul9Q80TT8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Cul9Q80TT8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
Cul9Q80TT8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
Cul9Q80TT8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Cul9Q80TT8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Cul9Q80TT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Cul9Q80TT8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
Cul9Q80TT8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Cul9Q80TT8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Cul9Q80TT8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
Cul9Q80TT8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Cul9Q80TT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
Cul9Q80TT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
Cul9Q80TT8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Cul9Q80TT8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
Cul9Q80TT8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Cul9Q80TT8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Cul9Q80TT8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Cul9Q80TT8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Cul9Q80TT8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Cul9Q80TT8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Cul9Q80TT8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Cul9Q80TT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Cul9Q80TT8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Cul9Q80TT8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cul9Q80TT8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Cul9Q80TT8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Cul9Q80TT8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Cul9Q80TT8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Cul9Q80TT8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Cul9Q80TT8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Cul9Q80TT8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Cul9Q80TT8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Cul9Q80TT8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
Cul9Q80TT8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Cul9Q80TT8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Cul9Q80TT8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Cul9Q80TT8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Cul9Q80TT8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Cul9Q80TT8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Cul9Q80TT8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Cul9Q80TT8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Cul9Q80TT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Cul9Q80TT8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cul9Q80TT8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cul9Q80TT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Cul9Q80TT8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Cul9Q80TT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Cul9Q80TT8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Cul9Q80TT8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Cul9Q80TT8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cul9Q80TT8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Cul9Q80TT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Cul9Q80TT8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Cul9Q80TT8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cul9Q80TT8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Cul9Q80TT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Cul9Q80TT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cul9Q80TT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cul9Q80TT8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Cul9Q80TT8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Cul9Q80TT8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms