RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Polr3aB2RXC6 1390 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 TnnQ80Z71 1560 aa20.66■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Emilin2Q8K482 1074 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Jmjd4Q8BFT6 427 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Bicdl1A0JNT9 577 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 OptnQ8K3K8 584 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cetn4Q8K4K1 168 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prex2Q3LAC4 1598 aa20.65■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adam1bQ8R534 806 aa20.64■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atl3Q91YH5 541 aa20.64■□□□□ 0.9
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hap1O35668 628 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ggnbp2Q5SV77 696 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 St18Q80TY4 1045 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc5a1Q8C3K6 665 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rusc2Q80U22 1514 aa20.64■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PrxO55103 1391 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc5Q3TPX4 708 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 VgfQ0VGU4 617 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dixdc1Q80Y83 711 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slx4Q6P1D7 1565 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hmox1P14901 289 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Krt82Q99M74 516 aa20.63■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pank1Q8K4K6 548 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ttc19Q8CC21 365 aa20.62■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q9D2X8 372 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plcd4Q8K3R3 807 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ArsiQ32KI9 573 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 KinQ8K339 391 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa20.61■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ell2Q3UKU1 639 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ttc5Q99LG4 440 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa20.6■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Lmod3E9QA62 571 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mcm2P97310 904 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cfap74Q3UY96 1578 aa20.59■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccne1Q61457 408 aa20.58■□□□□ 0.89
Fam171b-201ENSMUST00000051454 TnikP83510 1323 aa20.58■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dzip1Q8BMD2 852 aa20.58■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pde4dQ01063 747 aa20.57■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NpatQ8BMA5 1420 aa20.57■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Naip6Q9JIB6 1403 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cplx1P63040 134 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ehmt1Q5DW34 1296 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nap1l3Q794H2 544 aa20.56■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atp7aQ64430 1491 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Agtpbp1Q641K1 1218 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa20.55■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sos1Q62245 1319 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nphp1Q9QY53 687 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc6bA6H5Z3 810 aa20.54■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Washc4Q3UMB9 1173 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Abl1P00520 1123 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zkscan2G3X952 960 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fkbp5Q64378 456 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa20.53■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Me1P06801 572 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Strn4P58404 760 aa20.52■□□□□ 0.88
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kcnh8P59111 1102 aa20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rsph3aQ3UFY4 516 aa20.51■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Talpid3E9PV87 1520 aa20.5■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.5■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stk3Q9JI10 497 aa20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 SkilQ60665 675 aa20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Phactr2B1AVP0 632 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cchcr1Q8K2I2 770 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gsdma2Q32M21 443 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Odf2lQ9D478 642 aa20.48■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 A0A1L1SQF0 893 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ankrd13dQ6PD24 605 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hoxb7P09024 217 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cwc27Q3TKY6 469 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.47■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Casq1O09165 405 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 EappQ5BU09 281 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Erich6bQ9D4S6 220 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hoxa7P02830 229 aa20.46■□□□□ 0.87
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51 ms