Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,71■■■■■ 4,59
Odf2lQ9D478 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Odf2lQ9D478 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Odf2lQ9D478 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Odf2lQ9D478 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,13■■■■□ 3,86
Odf2lQ9D478 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Odf2lQ9D478 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,71■■■■□ 3,79
Odf2lQ9D478 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,91■■■■□ 3,66
Odf2lQ9D478 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Odf2lQ9D478 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Odf2lQ9D478 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Odf2lQ9D478 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Odf2lQ9D478 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Odf2lQ9D478 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Odf2lQ9D478 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Odf2lQ9D478 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Odf2lQ9D478 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
Odf2lQ9D478 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Odf2lQ9D478 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Odf2lQ9D478 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Odf2lQ9D478 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Odf2lQ9D478 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Odf2lQ9D478 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Odf2lQ9D478 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Odf2lQ9D478 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Odf2lQ9D478 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Odf2lQ9D478 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Odf2lQ9D478 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Odf2lQ9D478 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Odf2lQ9D478 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Odf2lQ9D478 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Odf2lQ9D478 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Odf2lQ9D478 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Odf2lQ9D478 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Odf2lQ9D478 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Odf2lQ9D478 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Odf2lQ9D478 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Odf2lQ9D478 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Odf2lQ9D478 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Odf2lQ9D478 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Odf2lQ9D478 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Odf2lQ9D478 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Odf2lQ9D478 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Odf2lQ9D478 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Odf2lQ9D478 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Odf2lQ9D478 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Odf2lQ9D478 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Odf2lQ9D478 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Odf2lQ9D478 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Odf2lQ9D478 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Odf2lQ9D478 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Odf2lQ9D478 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Odf2lQ9D478 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Odf2lQ9D478 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Odf2lQ9D478 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Odf2lQ9D478 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Odf2lQ9D478 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Odf2lQ9D478 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Odf2lQ9D478 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Odf2lQ9D478 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Odf2lQ9D478 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Odf2lQ9D478 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Odf2lQ9D478 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Odf2lQ9D478 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Odf2lQ9D478 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Odf2lQ9D478 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Odf2lQ9D478 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Odf2lQ9D478 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Odf2lQ9D478 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Odf2lQ9D478 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
Odf2lQ9D478 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Odf2lQ9D478 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Odf2lQ9D478 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Odf2lQ9D478 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Odf2lQ9D478 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Odf2lQ9D478 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Odf2lQ9D478 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Odf2lQ9D478 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Odf2lQ9D478 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Odf2lQ9D478 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Odf2lQ9D478 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Odf2lQ9D478 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Odf2lQ9D478 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
Odf2lQ9D478 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Odf2lQ9D478 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Odf2lQ9D478 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Odf2lQ9D478 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Odf2lQ9D478 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Odf2lQ9D478 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Odf2lQ9D478 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Odf2lQ9D478 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Odf2lQ9D478 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Odf2lQ9D478 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Odf2lQ9D478 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Odf2lQ9D478 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Odf2lQ9D478 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms