Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
Odf2lQ9D478 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Odf2lQ9D478 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Odf2lQ9D478 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Odf2lQ9D478 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Odf2lQ9D478 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Odf2lQ9D478 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Odf2lQ9D478 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Odf2lQ9D478 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Odf2lQ9D478 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Odf2lQ9D478 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Odf2lQ9D478 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Odf2lQ9D478 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Odf2lQ9D478 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Odf2lQ9D478 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Odf2lQ9D478 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Odf2lQ9D478 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Odf2lQ9D478 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Odf2lQ9D478 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Odf2lQ9D478 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Odf2lQ9D478 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Odf2lQ9D478 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Odf2lQ9D478 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Odf2lQ9D478 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Odf2lQ9D478 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Odf2lQ9D478 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Odf2lQ9D478 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Odf2lQ9D478 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Odf2lQ9D478 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Odf2lQ9D478 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Odf2lQ9D478 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Odf2lQ9D478 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Odf2lQ9D478 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Odf2lQ9D478 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Odf2lQ9D478 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Odf2lQ9D478 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Odf2lQ9D478 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Odf2lQ9D478 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Odf2lQ9D478 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Odf2lQ9D478 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Odf2lQ9D478 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Odf2lQ9D478 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Odf2lQ9D478 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Odf2lQ9D478 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Odf2lQ9D478 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Odf2lQ9D478 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Odf2lQ9D478 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Odf2lQ9D478 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Odf2lQ9D478 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Odf2lQ9D478 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Odf2lQ9D478 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Odf2lQ9D478 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Odf2lQ9D478 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Odf2lQ9D478 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Odf2lQ9D478 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Odf2lQ9D478 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Odf2lQ9D478 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Odf2lQ9D478 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Odf2lQ9D478 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Odf2lQ9D478 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Odf2lQ9D478 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Odf2lQ9D478 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Odf2lQ9D478 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Odf2lQ9D478 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Odf2lQ9D478 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Odf2lQ9D478 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Odf2lQ9D478 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Odf2lQ9D478 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Odf2lQ9D478 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Odf2lQ9D478 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Odf2lQ9D478 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Odf2lQ9D478 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Odf2lQ9D478 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Odf2lQ9D478 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Odf2lQ9D478 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Odf2lQ9D478 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Odf2lQ9D478 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Odf2lQ9D478 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Odf2lQ9D478 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Odf2lQ9D478 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Odf2lQ9D478 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Odf2lQ9D478 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Odf2lQ9D478 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Odf2lQ9D478 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Odf2lQ9D478 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Odf2lQ9D478 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Odf2lQ9D478 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Odf2lQ9D478 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Odf2lQ9D478 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Odf2lQ9D478 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Odf2lQ9D478 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Odf2lQ9D478 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Odf2lQ9D478 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Odf2lQ9D478 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Odf2lQ9D478 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Odf2lQ9D478 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Odf2lQ9D478 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Odf2lQ9D478 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms