Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,62■■■■■ 4,73
Hoxa7P02830 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Hoxa7P02830 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Hoxa7P02830 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Hoxa7P02830 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,78■■■■■ 4,12
Hoxa7P02830 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Hoxa7P02830 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
Hoxa7P02830 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Hoxa7P02830 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
Hoxa7P02830 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,03■■■■□ 3,84
Hoxa7P02830 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Hoxa7P02830 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Hoxa7P02830 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,43■■■■□ 3,74
Hoxa7P02830 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Hoxa7P02830 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
Hoxa7P02830 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Hoxa7P02830 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Hoxa7P02830 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Hoxa7P02830 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Hoxa7P02830 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Hoxa7P02830 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Hoxa7P02830 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Hoxa7P02830 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,48■■■■□ 3,59
Hoxa7P02830 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Hoxa7P02830 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,58
Hoxa7P02830 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Hoxa7P02830 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Hoxa7P02830 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Hoxa7P02830 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Hoxa7P02830 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Hoxa7P02830 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Hoxa7P02830 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Hoxa7P02830 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Hoxa7P02830 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Hoxa7P02830 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Hoxa7P02830 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Hoxa7P02830 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Hoxa7P02830 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Hoxa7P02830 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Hoxa7P02830 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Hoxa7P02830 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Hoxa7P02830 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Hoxa7P02830 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Hoxa7P02830 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Hoxa7P02830 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Hoxa7P02830 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Hoxa7P02830 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Hoxa7P02830 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Hoxa7P02830 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Hoxa7P02830 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Hoxa7P02830 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Hoxa7P02830 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Hoxa7P02830 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Hoxa7P02830 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Hoxa7P02830 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Hoxa7P02830 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Hoxa7P02830 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Hoxa7P02830 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Hoxa7P02830 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Hoxa7P02830 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Hoxa7P02830 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Hoxa7P02830 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Hoxa7P02830 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Hoxa7P02830 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
Hoxa7P02830 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Hoxa7P02830 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Hoxa7P02830 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Hoxa7P02830 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Hoxa7P02830 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
Hoxa7P02830 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Hoxa7P02830 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Hoxa7P02830 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Hoxa7P02830 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Hoxa7P02830 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Hoxa7P02830 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Hoxa7P02830 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Hoxa7P02830 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Hoxa7P02830 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Hoxa7P02830 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Hoxa7P02830 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Hoxa7P02830 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Hoxa7P02830 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Hoxa7P02830 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Hoxa7P02830 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Hoxa7P02830 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Hoxa7P02830 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Hoxa7P02830 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Hoxa7P02830 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Hoxa7P02830 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Hoxa7P02830 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Hoxa7P02830 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Hoxa7P02830 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Hoxa7P02830 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Hoxa7P02830 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Hoxa7P02830 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Hoxa7P02830 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hoxa7P02830 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Hoxa7P02830 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Hoxa7P02830 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Hoxa7P02830 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,7 ms