Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE6

Ipo9, Importin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo9Q91YE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Ipo9Q91YE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,38■■■■■ 4,21
Ipo9Q91YE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Ipo9Q91YE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Ipo9Q91YE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,64■■■■■ 4,1
Ipo9Q91YE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Ipo9Q91YE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Ipo9Q91YE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Ipo9Q91YE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ipo9Q91YE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Ipo9Q91YE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Ipo9Q91YE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Ipo9Q91YE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Ipo9Q91YE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Ipo9Q91YE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Ipo9Q91YE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Ipo9Q91YE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Ipo9Q91YE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Ipo9Q91YE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Ipo9Q91YE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Ipo9Q91YE6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Ipo9Q91YE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,07■■■■□ 3,52
Ipo9Q91YE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Ipo9Q91YE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Ipo9Q91YE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Ipo9Q91YE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Ipo9Q91YE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,88■■■■□ 3,49
Ipo9Q91YE6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ipo9Q91YE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Ipo9Q91YE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Ipo9Q91YE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Ipo9Q91YE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Ipo9Q91YE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Ipo9Q91YE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Ipo9Q91YE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ipo9Q91YE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Ipo9Q91YE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Ipo9Q91YE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Ipo9Q91YE6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Ipo9Q91YE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Ipo9Q91YE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Ipo9Q91YE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Ipo9Q91YE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,72■■■■□ 3,31
Ipo9Q91YE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Ipo9Q91YE6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Ipo9Q91YE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ipo9Q91YE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Ipo9Q91YE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ipo9Q91YE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Ipo9Q91YE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Ipo9Q91YE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Ipo9Q91YE6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Ipo9Q91YE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Ipo9Q91YE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
Ipo9Q91YE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ipo9Q91YE6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Ipo9Q91YE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Ipo9Q91YE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Ipo9Q91YE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Ipo9Q91YE6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Ipo9Q91YE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Ipo9Q91YE6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Ipo9Q91YE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Ipo9Q91YE6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Ipo9Q91YE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Ipo9Q91YE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Ipo9Q91YE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Ipo9Q91YE6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Ipo9Q91YE6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,17
Ipo9Q91YE6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Ipo9Q91YE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Ipo9Q91YE6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Ipo9Q91YE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Ipo9Q91YE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Ipo9Q91YE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Ipo9Q91YE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Ipo9Q91YE6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Ipo9Q91YE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Ipo9Q91YE6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Ipo9Q91YE6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Ipo9Q91YE6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Ipo9Q91YE6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ipo9Q91YE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Ipo9Q91YE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Ipo9Q91YE6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Ipo9Q91YE6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Ipo9Q91YE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Ipo9Q91YE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Ipo9Q91YE6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Ipo9Q91YE6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Ipo9Q91YE6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Ipo9Q91YE6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Ipo9Q91YE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Ipo9Q91YE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Ipo9Q91YE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Ipo9Q91YE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Ipo9Q91YE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Ipo9Q91YE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Ipo9Q91YE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Ipo9Q91YE6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms