Protein–RNA interactions for Protein: Q794H2

Nap1l3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nap1l3Q794H2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Nap1l3Q794H2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
Nap1l3Q794H2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,73■■■■□ 3,79
Nap1l3Q794H2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,64■■■■□ 3,78
Nap1l3Q794H2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,39■■■■□ 3,58
Nap1l3Q794H2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Nap1l3Q794H2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Nap1l3Q794H2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Nap1l3Q794H2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nap1l3Q794H2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Nap1l3Q794H2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,44■■■■□ 3,42
Nap1l3Q794H2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Nap1l3Q794H2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Nap1l3Q794H2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Nap1l3Q794H2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,88■■■■□ 3,34
Nap1l3Q794H2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Nap1l3Q794H2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Nap1l3Q794H2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Nap1l3Q794H2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Nap1l3Q794H2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Nap1l3Q794H2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Nap1l3Q794H2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nap1l3Q794H2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nap1l3Q794H2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nap1l3Q794H2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Nap1l3Q794H2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Nap1l3Q794H2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,17
Nap1l3Q794H2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Nap1l3Q794H2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Nap1l3Q794H2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,73■■■■□ 3,15
Nap1l3Q794H2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Nap1l3Q794H2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Nap1l3Q794H2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Nap1l3Q794H2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Nap1l3Q794H2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Nap1l3Q794H2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nap1l3Q794H2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Nap1l3Q794H2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Nap1l3Q794H2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Nap1l3Q794H2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Nap1l3Q794H2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Nap1l3Q794H2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Nap1l3Q794H2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Nap1l3Q794H2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Nap1l3Q794H2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Nap1l3Q794H2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Nap1l3Q794H2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Nap1l3Q794H2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Nap1l3Q794H2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Nap1l3Q794H2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Nap1l3Q794H2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Nap1l3Q794H2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Nap1l3Q794H2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Nap1l3Q794H2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Nap1l3Q794H2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Nap1l3Q794H2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Nap1l3Q794H2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Nap1l3Q794H2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Nap1l3Q794H2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Nap1l3Q794H2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Nap1l3Q794H2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Nap1l3Q794H2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Nap1l3Q794H2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Nap1l3Q794H2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Nap1l3Q794H2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Nap1l3Q794H2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Nap1l3Q794H2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Nap1l3Q794H2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Nap1l3Q794H2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Nap1l3Q794H2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Nap1l3Q794H2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Nap1l3Q794H2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Nap1l3Q794H2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Nap1l3Q794H2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Nap1l3Q794H2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Nap1l3Q794H2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Nap1l3Q794H2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Nap1l3Q794H2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Nap1l3Q794H2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Nap1l3Q794H2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Nap1l3Q794H2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Nap1l3Q794H2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Nap1l3Q794H2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Nap1l3Q794H2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Nap1l3Q794H2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Nap1l3Q794H2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Nap1l3Q794H2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Nap1l3Q794H2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Nap1l3Q794H2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Nap1l3Q794H2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Nap1l3Q794H2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Nap1l3Q794H2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Nap1l3Q794H2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nap1l3Q794H2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nap1l3Q794H2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms