Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Erich6bQ9D4S6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Erich6bQ9D4S6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Erich6bQ9D4S6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Erich6bQ9D4S6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Erich6bQ9D4S6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Erich6bQ9D4S6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Erich6bQ9D4S6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Erich6bQ9D4S6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Erich6bQ9D4S6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Erich6bQ9D4S6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Erich6bQ9D4S6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Erich6bQ9D4S6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Erich6bQ9D4S6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Erich6bQ9D4S6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Erich6bQ9D4S6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Erich6bQ9D4S6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Erich6bQ9D4S6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Erich6bQ9D4S6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Erich6bQ9D4S6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Erich6bQ9D4S6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
Erich6bQ9D4S6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Erich6bQ9D4S6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Erich6bQ9D4S6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Erich6bQ9D4S6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Erich6bQ9D4S6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Erich6bQ9D4S6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Erich6bQ9D4S6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Erich6bQ9D4S6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Erich6bQ9D4S6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Erich6bQ9D4S6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,96
Erich6bQ9D4S6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Erich6bQ9D4S6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Erich6bQ9D4S6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Erich6bQ9D4S6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Erich6bQ9D4S6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Erich6bQ9D4S6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Erich6bQ9D4S6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Erich6bQ9D4S6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Erich6bQ9D4S6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Erich6bQ9D4S6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Erich6bQ9D4S6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Erich6bQ9D4S6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Erich6bQ9D4S6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Erich6bQ9D4S6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Erich6bQ9D4S6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Erich6bQ9D4S6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Erich6bQ9D4S6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Erich6bQ9D4S6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Erich6bQ9D4S6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Erich6bQ9D4S6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Erich6bQ9D4S6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Erich6bQ9D4S6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Erich6bQ9D4S6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Erich6bQ9D4S6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Erich6bQ9D4S6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Erich6bQ9D4S6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Erich6bQ9D4S6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Erich6bQ9D4S6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Erich6bQ9D4S6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Erich6bQ9D4S6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Erich6bQ9D4S6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Erich6bQ9D4S6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Erich6bQ9D4S6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Erich6bQ9D4S6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Erich6bQ9D4S6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Erich6bQ9D4S6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Erich6bQ9D4S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Erich6bQ9D4S6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Erich6bQ9D4S6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Erich6bQ9D4S6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Erich6bQ9D4S6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Erich6bQ9D4S6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Erich6bQ9D4S6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Erich6bQ9D4S6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Erich6bQ9D4S6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Erich6bQ9D4S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Erich6bQ9D4S6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Erich6bQ9D4S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Erich6bQ9D4S6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Erich6bQ9D4S6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Erich6bQ9D4S6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Erich6bQ9D4S6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Erich6bQ9D4S6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Erich6bQ9D4S6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Erich6bQ9D4S6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Erich6bQ9D4S6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Erich6bQ9D4S6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Erich6bQ9D4S6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Erich6bQ9D4S6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Erich6bQ9D4S6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Erich6bQ9D4S6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Erich6bQ9D4S6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Erich6bQ9D4S6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Erich6bQ9D4S6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Erich6bQ9D4S6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Erich6bQ9D4S6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Erich6bQ9D4S6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Erich6bQ9D4S6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Erich6bQ9D4S6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms