Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,59■■■■■ 4,73
Zkscan2G3X952 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Zkscan2G3X952 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Zkscan2G3X952 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Zkscan2G3X952 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Zkscan2G3X952 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Zkscan2G3X952 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,64■■■■□ 3,94
Zkscan2G3X952 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Zkscan2G3X952 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Zkscan2G3X952 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,9■■■■□ 3,82
Zkscan2G3X952 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,34■■■■□ 3,73
Zkscan2G3X952 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Zkscan2G3X952 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,23■■■■□ 3,71
Zkscan2G3X952 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Zkscan2G3X952 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Zkscan2G3X952 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Zkscan2G3X952 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Zkscan2G3X952 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Zkscan2G3X952 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Zkscan2G3X952 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Zkscan2G3X952 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Zkscan2G3X952 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Zkscan2G3X952 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Zkscan2G3X952 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
Zkscan2G3X952 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Zkscan2G3X952 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Zkscan2G3X952 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Zkscan2G3X952 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Zkscan2G3X952 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Zkscan2G3X952 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Zkscan2G3X952 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Zkscan2G3X952 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Zkscan2G3X952 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Zkscan2G3X952 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Zkscan2G3X952 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Zkscan2G3X952 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Zkscan2G3X952 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,46■■■■□ 3,43
Zkscan2G3X952 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Zkscan2G3X952 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Zkscan2G3X952 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Zkscan2G3X952 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Zkscan2G3X952 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Zkscan2G3X952 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Zkscan2G3X952 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Zkscan2G3X952 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Zkscan2G3X952 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Zkscan2G3X952 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Zkscan2G3X952 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Zkscan2G3X952 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Zkscan2G3X952 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Zkscan2G3X952 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Zkscan2G3X952 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Zkscan2G3X952 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Zkscan2G3X952 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Zkscan2G3X952 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Zkscan2G3X952 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Zkscan2G3X952 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Zkscan2G3X952 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Zkscan2G3X952 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Zkscan2G3X952 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
Zkscan2G3X952 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Zkscan2G3X952 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Zkscan2G3X952 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Zkscan2G3X952 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Zkscan2G3X952 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Zkscan2G3X952 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Zkscan2G3X952 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Zkscan2G3X952 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Zkscan2G3X952 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Zkscan2G3X952 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Zkscan2G3X952 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Zkscan2G3X952 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Zkscan2G3X952 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Zkscan2G3X952 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Zkscan2G3X952 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Zkscan2G3X952 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Zkscan2G3X952 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Zkscan2G3X952 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Zkscan2G3X952 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Zkscan2G3X952 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Zkscan2G3X952 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Zkscan2G3X952 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Zkscan2G3X952 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Zkscan2G3X952 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Zkscan2G3X952 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Zkscan2G3X952 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Zkscan2G3X952 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Zkscan2G3X952 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms