Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45■■■■■ 4.79
Cyp46a1Q9WVK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Cyp46a1Q9WVK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cyp46a1Q9WVK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Cyp46a1Q9WVK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Cyp46a1Q9WVK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Cyp46a1Q9WVK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Cyp46a1Q9WVK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cyp46a1Q9WVK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Cyp46a1Q9WVK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cyp46a1Q9WVK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cyp46a1Q9WVK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cyp46a1Q9WVK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cyp46a1Q9WVK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cyp46a1Q9WVK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Cyp46a1Q9WVK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cyp46a1Q9WVK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cyp46a1Q9WVK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cyp46a1Q9WVK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cyp46a1Q9WVK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cyp46a1Q9WVK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cyp46a1Q9WVK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cyp46a1Q9WVK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cyp46a1Q9WVK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cyp46a1Q9WVK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cyp46a1Q9WVK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cyp46a1Q9WVK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Cyp46a1Q9WVK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cyp46a1Q9WVK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cyp46a1Q9WVK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cyp46a1Q9WVK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cyp46a1Q9WVK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cyp46a1Q9WVK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Cyp46a1Q9WVK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cyp46a1Q9WVK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cyp46a1Q9WVK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cyp46a1Q9WVK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cyp46a1Q9WVK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cyp46a1Q9WVK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cyp46a1Q9WVK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cyp46a1Q9WVK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cyp46a1Q9WVK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cyp46a1Q9WVK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cyp46a1Q9WVK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cyp46a1Q9WVK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cyp46a1Q9WVK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cyp46a1Q9WVK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cyp46a1Q9WVK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cyp46a1Q9WVK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cyp46a1Q9WVK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cyp46a1Q9WVK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cyp46a1Q9WVK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cyp46a1Q9WVK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cyp46a1Q9WVK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cyp46a1Q9WVK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cyp46a1Q9WVK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cyp46a1Q9WVK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cyp46a1Q9WVK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cyp46a1Q9WVK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cyp46a1Q9WVK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cyp46a1Q9WVK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cyp46a1Q9WVK8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cyp46a1Q9WVK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cyp46a1Q9WVK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms