Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45■■■■■ 4,79
Cyp46a1Q9WVK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Cyp46a1Q9WVK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,3■■■■■ 4,2
Cyp46a1Q9WVK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Cyp46a1Q9WVK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,8■■■■■ 4,12
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
Cyp46a1Q9WVK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,21■■■■□ 3,87
Cyp46a1Q9WVK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
Cyp46a1Q9WVK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,72■■■■□ 3,79
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Cyp46a1Q9WVK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,46■■■■□ 3,75
Cyp46a1Q9WVK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Cyp46a1Q9WVK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Cyp46a1Q9WVK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cyp46a1Q9WVK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Cyp46a1Q9WVK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Cyp46a1Q9WVK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,65■■■■□ 3,62
Cyp46a1Q9WVK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Cyp46a1Q9WVK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Cyp46a1Q9WVK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cyp46a1Q9WVK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Cyp46a1Q9WVK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cyp46a1Q9WVK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Cyp46a1Q9WVK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Cyp46a1Q9WVK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Cyp46a1Q9WVK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Cyp46a1Q9WVK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cyp46a1Q9WVK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cyp46a1Q9WVK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
Cyp46a1Q9WVK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cyp46a1Q9WVK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Cyp46a1Q9WVK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cyp46a1Q9WVK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cyp46a1Q9WVK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Cyp46a1Q9WVK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
Cyp46a1Q9WVK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Cyp46a1Q9WVK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Cyp46a1Q9WVK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Cyp46a1Q9WVK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cyp46a1Q9WVK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Cyp46a1Q9WVK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cyp46a1Q9WVK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cyp46a1Q9WVK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cyp46a1Q9WVK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Cyp46a1Q9WVK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cyp46a1Q9WVK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,14■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,14■■■■□ 3,22
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Cyp46a1Q9WVK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Cyp46a1Q9WVK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cyp46a1Q9WVK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cyp46a1Q9WVK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cyp46a1Q9WVK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cyp46a1Q9WVK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Cyp46a1Q9WVK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Cyp46a1Q9WVK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Cyp46a1Q9WVK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Cyp46a1Q9WVK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Cyp46a1Q9WVK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Cyp46a1Q9WVK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Cyp46a1Q9WVK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Cyp46a1Q9WVK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cyp46a1Q9WVK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cyp46a1Q9WVK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Cyp46a1Q9WVK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Cyp46a1Q9WVK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Cyp46a1Q9WVK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Cyp46a1Q9WVK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Cyp46a1Q9WVK8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Cyp46a1Q9WVK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Cyp46a1Q9WVK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms