Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,85■■■■■ 4,29
Cplx1P63040 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Cplx1P63040 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Cplx1P63040 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Cplx1P63040 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Cplx1P63040 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Cplx1P63040 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
Cplx1P63040 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Cplx1P63040 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,69■■■■□ 3,46
Cplx1P63040 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,49■■■■□ 3,43
Cplx1P63040 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Cplx1P63040 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Cplx1P63040 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Cplx1P63040 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Cplx1P63040 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Cplx1P63040 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cplx1P63040 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cplx1P63040 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Cplx1P63040 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Cplx1P63040 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cplx1P63040 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Cplx1P63040 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cplx1P63040 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cplx1P63040 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Cplx1P63040 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,07■■■■□ 3,2
Cplx1P63040 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Cplx1P63040 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,95■■■■□ 3,18
Cplx1P63040 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cplx1P63040 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cplx1P63040 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cplx1P63040 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cplx1P63040 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Cplx1P63040 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cplx1P63040 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cplx1P63040 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cplx1P63040 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Cplx1P63040 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Cplx1P63040 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Cplx1P63040 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Cplx1P63040 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Cplx1P63040 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Cplx1P63040 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Cplx1P63040 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Cplx1P63040 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,78■■■■□ 3
Cplx1P63040 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Cplx1P63040 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cplx1P63040 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Cplx1P63040 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cplx1P63040 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cplx1P63040 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cplx1P63040 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cplx1P63040 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cplx1P63040 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cplx1P63040 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cplx1P63040 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Cplx1P63040 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Cplx1P63040 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Cplx1P63040 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Cplx1P63040 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Cplx1P63040 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Cplx1P63040 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cplx1P63040 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Cplx1P63040 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Cplx1P63040 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cplx1P63040 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Cplx1P63040 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Cplx1P63040 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Cplx1P63040 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Cplx1P63040 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cplx1P63040 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cplx1P63040 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Cplx1P63040 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cplx1P63040 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cplx1P63040 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cplx1P63040 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cplx1P63040 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cplx1P63040 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cplx1P63040 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Cplx1P63040 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cplx1P63040 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cplx1P63040 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cplx1P63040 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Cplx1P63040 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cplx1P63040 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Cplx1P63040 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Cplx1P63040 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Cplx1P63040 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cplx1P63040 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Cplx1P63040 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cplx1P63040 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cplx1P63040 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,06■■■□□ 2,72
Cplx1P63040 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Cplx1P63040 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Cplx1P63040 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Cplx1P63040 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Cplx1P63040 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Cplx1P63040 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Cplx1P63040 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,7
Cplx1P63040 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cplx1P63040 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms