RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp19Q3UJD6 1360 aa16.43■□□□□ 0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plcd4Q8K3R3 807 aa16.26■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C5P06684 1680 aa16.26■□□□□ 0.19
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif1aP33173 1695 aa16.23■□□□□ 0.19
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspyl2Q7TQI8 677 aa16.22■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlgn1Q99K10 843 aa16.22■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa16.21■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4a2P10630 407 aa16.21■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cabp2Q9JLK4 216 aa16.21■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn4aQ9ER60 1841 aa16.21■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArxO35085 564 aa16.21■□□□□ 0.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa16.2■□□□□ 0.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Parp14Q2EMV9 1817 aa16.2■□□□□ 0.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim30dE9PWL0 497 aa16.2■□□□□ 0.18
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q4VA45 678 aa16.19■□□□□ 0.18
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