Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61,41■■■■■ 7,42
Alpk3Q924C5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57,59■■■■■ 6,81
Alpk3Q924C5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,26■■■■■ 6,6
Alpk3Q924C5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC54,04■■■■■ 6,24
Alpk3Q924C5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52,29■■■■■ 5,96
Alpk3Q924C5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,05■■■■■ 5,92
Alpk3Q924C5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5,91
Alpk3Q924C5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51,84■■■■■ 5,89
Alpk3Q924C5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,14■■■■■ 5,78
Alpk3Q924C5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51,08■■■■■ 5,77
Alpk3Q924C5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51■■■■■ 5,75
Alpk3Q924C5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50,84■■■■■ 5,73
Alpk3Q924C5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,51■■■■■ 5,68
Alpk3Q924C5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,45■■■■■ 5,67
Alpk3Q924C5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50,37■■■■■ 5,65
Alpk3Q924C5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC50,13■■■■■ 5,62
Alpk3Q924C5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,2■■■■■ 5,47
Alpk3Q924C5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC49,01■■■■■ 5,44
Alpk3Q924C5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48,92■■■■■ 5,42
Alpk3Q924C5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,85■■■■■ 5,41
Alpk3Q924C5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,76■■■■■ 5,4
Alpk3Q924C5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48,31■■■■■ 5,32
Alpk3Q924C5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47,98■■■■■ 5,27
Alpk3Q924C5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47,97■■■■■ 5,27
Alpk3Q924C5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,76■■■■■ 5,24
Alpk3Q924C5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47,42■■■■■ 5,18
Alpk3Q924C5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47,32■■■■■ 5,17
Alpk3Q924C5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47,1■■■■■ 5,13
Alpk3Q924C5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47,05■■■■■ 5,12
Alpk3Q924C5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46,96■■■■■ 5,11
Alpk3Q924C5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46,88■■■■■ 5,1
Alpk3Q924C5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46,74■■■■■ 5,07
Alpk3Q924C5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,72■■■■■ 5,07
Alpk3Q924C5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46,59■■■■■ 5,05
Alpk3Q924C5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC46,4■■■■■ 5,02
Alpk3Q924C5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,24■■■■■ 4,99
Alpk3Q924C5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46,2■■■■■ 4,99
Alpk3Q924C5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,13■■■■■ 4,97
Alpk3Q924C5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,12■■■■■ 4,97
Alpk3Q924C5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45,83■■■■■ 4,93
Alpk3Q924C5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,8■■■■■ 4,92
Alpk3Q924C5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,69■■■■■ 4,9
Alpk3Q924C5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,63■■■■■ 4,9
Alpk3Q924C5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45,63■■■■■ 4,89
Alpk3Q924C5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45,63■■■■■ 4,89
Alpk3Q924C5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45,53■■■■■ 4,88
Alpk3Q924C5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45,51■■■■■ 4,88
Alpk3Q924C5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45,41■■■■■ 4,86
Alpk3Q924C5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45,23■■■■■ 4,83
Alpk3Q924C5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45,15■■■■■ 4,82
Alpk3Q924C5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,08■■■■■ 4,81
Alpk3Q924C5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,06■■■■■ 4,8
Alpk3Q924C5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44,89■■■■■ 4,78
Alpk3Q924C5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44,88■■■■■ 4,78
Alpk3Q924C5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,86■■■■■ 4,77
Alpk3Q924C5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,77
Alpk3Q924C5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44,77■■■■■ 4,76
Alpk3Q924C5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,75■■■■■ 4,75
Alpk3Q924C5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,69■■■■■ 4,74
Alpk3Q924C5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,67■■■■■ 4,74
Alpk3Q924C5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,67■■■■■ 4,74
Alpk3Q924C5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44,65■■■■■ 4,74
Alpk3Q924C5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44,58■■■■■ 4,73
Alpk3Q924C5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44,57■■■■■ 4,73
Alpk3Q924C5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,45■■■■■ 4,71
Alpk3Q924C5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44,44■■■■■ 4,7
Alpk3Q924C5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,43■■■■■ 4,7
Alpk3Q924C5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,38■■■■■ 4,69
Alpk3Q924C5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44,35■■■■■ 4,69
Alpk3Q924C5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44,3■■■■■ 4,68
Alpk3Q924C5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Alpk3Q924C5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44,23■■■■■ 4,67
Alpk3Q924C5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Alpk3Q924C5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Alpk3Q924C5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,1■■■■■ 4,65
Alpk3Q924C5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Alpk3Q924C5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Alpk3Q924C5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Alpk3Q924C5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,84■■■■■ 4,61
Alpk3Q924C5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
Alpk3Q924C5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Alpk3Q924C5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Alpk3Q924C5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43,77■■■■■ 4,6
Alpk3Q924C5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,72■■■■■ 4,59
Alpk3Q924C5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,69■■■■■ 4,58
Alpk3Q924C5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43,66■■■■■ 4,58
Alpk3Q924C5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43,64■■■■■ 4,58
Alpk3Q924C5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43,59■■■■■ 4,57
Alpk3Q924C5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Alpk3Q924C5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,56■■■■■ 4,56
Alpk3Q924C5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,54■■■■■ 4,56
Alpk3Q924C5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43,35■■■■■ 4,53
Alpk3Q924C5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Alpk3Q924C5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Alpk3Q924C5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
Alpk3Q924C5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Alpk3Q924C5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Alpk3Q924C5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43,2■■■■■ 4,51
Alpk3Q924C5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Alpk3Q924C5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43,17■■■■■ 4,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms