RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W PRY3P47033 881 aa11.62□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W GYP7P48365 746 aa11.62□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W SAC3P46674 1301 aa11.61□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W YDR306CQ06640 478 aa11.61□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W PSH1Q12161 406 aa11.6□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W GAL2P13181 574 aa11.59□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W YJR008WP47085 338 aa11.59□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W IOC4Q04213 475 aa11.59□□□□□ -0.55
YLR349WYLR349W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data11.58□□□□□ -0.56not detected
YLR349WYLR349W YJL171CP46992 396 aa11.58□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W SRC1Q03707 834 aa11.58□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W MRP7P12687 371 aa11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W PAH1P32567 862 aa11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W JJJ2P46997 583 aa11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W SRT1Q03175 343 aa11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W SET1P38827 1080 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W SPR3P41901 512 aa11.56□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W MPP10P47083 593 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W YGR122WP53272 402 aa11.56□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W GIN4Q12263 1142 aa11.56□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W FBP1P09201 348 aa11.55□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W RPT3P33298 428 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W HXT10P43581 546 aa11.55□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W ULP1Q02724 621 aa11.55□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W PPM2Q08282 695 aa11.53□□□□□ -0.56
YLR349WYLR349W SWC3P31376 625 aa11.52□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W PSF2P40359 213 aa11.51□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W FLO1P32768 1537 aa11.5□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W IXR1P33417 597 aa11.5□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W MTC5Q03897 1148 aa11.5□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W TPD3P31383 635 aa11.49□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W PUS6P53294 404 aa11.49□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W SUP35P05453 685 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W RAD53P22216 821 aa11.47□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W ERG7P38604 731 aa11.47□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W YFH7P43591 353 aa11.47□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W PSF3Q12146 194 aa11.47□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W CLA4P48562 842 aa11.46□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
YLR349WYLR349W RAD24P32641 659 aa11.45□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W UBP12P39538 1254 aa11.45□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W NUG1P40010 520 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W VPS62P53285 467 aa11.44□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W ADR1P07248 1323 aa11.43□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W PMA1P05030 918 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W ADP1P25371 1049 aa11.43□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W ATG1P53104 897 aa11.43□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W SPT21P35209 758 aa11.42□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W YIR042CP40586 236 aa11.42□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W LDH1P38139 375 aa11.41□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W APL6P46682 809 aa11.41□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W YDL144CQ07589 356 aa11.41□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W SLA1P32790 1244 aa11.4□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W DLD1P32891 587 aa11.4□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W NET1P47035 1189 aa11.4□□□□□ -0.58
YLR349WYLR349W SNF3P10870 884 aa11.39□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W ACA1P39970 489 aa11.39□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W NSG2P53898 299 aa11.39□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W OCT1P35999 772 aa11.38□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W TUB2P02557 457 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W INM2Q05533 292 aa11.37□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W MDL2P33311 773 aa11.36□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W MCD4P36051 919 aa11.36□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W GLO3P38682 493 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W YBL028CP38202 106 aa11.35□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W BOI2P39969 1040 aa11.35□□□□□ -0.59
YLR349WYLR349W SRS2P12954 1174 aa11.33□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W FIR1P40020 876 aa11.33□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W TY3A-GQ12173 290 aa11.33□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W YOR131CQ12486 218 aa11.33□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W TY3A-IQ99219 290 aa11.33□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W SEC18P18759 758 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W ECM30Q06673 1274 aa11.32□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W AI2P03876 854 aa11.31□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W LYS14P40971 790 aa11.31□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W BRE5P53741 515 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W YMR084WA2P2R3 262 aa11.3□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W EAR1Q03212 550 aa11.3□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W RRI2Q12348 645 aa11.3□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W HAL5P38970 855 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W VAB2P40003 282 aa11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W YJL007CP47080 104 aa11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W YNL193WP53870 558 aa11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W CSI1Q04368 295 aa11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W ICL2Q12031 575 aa11.29□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data11.29□□□□□ -0.6not detected
YLR349WYLR349W UIP5P36137 443 aa11.28□□□□□ -0.6
YLR349WYLR349W YPP1P46951 817 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.1 ms