RNA–Protein interactions for RNA: YGL171W

ROK1, Transcript of RNA-dependent ATPase, yeast

Gene ROK1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROK1	YGL171W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	SPR3	P41901	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	CYC8	P14922	966 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	VAN1	P23642	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	CDC11	P32458	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	RPN12	P32496	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	TIM54	P47045	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	YNL115C	P53925	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	SPO20	Q04359	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	TFB4	Q12004	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	TSC13	Q99190	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	DPB3	P27344	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	THI4	P32318	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	SUV3	P32580	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	SOH1	P38633	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	YGR122W	P53272	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	FRA1	Q07825	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROK1	YGL171W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NFU1	P32860	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ATG3	P40344	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	APL6	P46682	809 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	PUS6	P53294	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NMA111	P53920	997 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
ROK1	YGL171W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	MPC54	Q08550	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TRS33	Q99394	268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ADR1	P07248	1323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	AI4	P03878	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	PRI2	P20457	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SLI15	P38283	698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	IES1	P43579	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ATG16	Q03818	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TOS4	Q06266	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	GYP1	Q08484	637 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SLX4	Q12098	748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ERP4	Q12450	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	CDC73	Q06697	393 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	RPB10	P22139	70 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TYW3	P53177	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YGR021W	P53212	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TUB4	P53378	473 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TMA17	Q12513	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TEC1	P18412	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	VPS35	P34110	944 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YKL069W	P36088	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YJR120W	P47157	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	PEX21	P50091	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	FLC1	Q08967	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	YRR1	Q12172	810 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	PIF1	P07271	859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	IES5	P40060	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	BDP1	P46678	594 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SAM37	P50110	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	UFD2	P54860	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TBF1	Q02457	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	OPI10	Q08202	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	GUT2	P32191	649 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	FAA3	P39002	694 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	FIG4	P42837	879 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	DAS1	P47005	663 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NTG2	Q08214	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SSN2	P38931	1420 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	CDC34	P14682	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	BLI1	P35727	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	VID27	P40157	782 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	NIT1	P40447	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROK1	YGL171W	SND1	Q04007	877 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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