RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	GEF1	P37020	779 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	YTA6	P40328	754 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	ALD2	P47771	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	YNR014W	P53719	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	YBR197C	P38306	217 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECO1	YFR027W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	PNP1	Q05788	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	RGP1	P16664	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	MRPL33	P20084	86 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	ISC10	P32645	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	MRPL16	P38064	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	BOI2	P39969	1040 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	SKP1	P52286	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	MCA1	Q08601	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	RPC31	P17890	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	KAP122	P32767	1081 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	SPR3	P41901	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	STB3	Q12427	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	FPS1	P23900	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	VMA3	P25515	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	RRN6	P32786	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	CAB3	P36076	571 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	BOL3	P39724	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	QDR2	P40474	542 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	MTO1	P53070	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	APC11	Q12157	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	DYS1	P38791	387 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECO1	YFR027W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	LSB6	P42951	607 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	KTR2	P33550	425 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	LDH1	P38139	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	MSC7	P38694	644 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	KAR5	Q04746	504 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	APM2	P38700	605 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	HEH2	Q03281	663 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	MET1	P36150	593 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	GIP1	P38229	639 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	ATG1	P53104	897 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	MSN1	P22148	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
ECO1	YFR027W	TAT1	P38085	619 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	HXT8	P40886	569 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	PRY1	P47032	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	RPB10	P22139	70 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	ISW1	P38144	1129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	BSD2	P38356	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	ACF4	P47129	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	ITC1	P53125	1264 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	YNR040W	P53736	256 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ECO1	YFR027W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	QDR1	P40475	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	HAT1	Q12341	374 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	SMC1	P32908	1225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	YBR287W	P38355	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	ERP5	P38819	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	FIR1	P40020	876 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	NTA1	P40354	457 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	RGD2	P43556	714 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	IDI1	P15496	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	MAC1	P35192	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	PRK1	P40494	810 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	MDJ2	P42834	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	UFD2	P54860	961 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	RAD55	P38953	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	YIL165C	P40446	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	RSC2	Q06488	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	AIM46	P38885	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	PSY2	P40164	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	INP52	P50942	1183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECO1	YFR027W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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