RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Amigo3Q8C2S7 508 aa42,72■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa42,72■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nwd1A6H603 1563 aa42,7■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Usp32F8VPZ3 1604 aa42,7■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP42,7■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mink1Q9JM52 1308 aa42,7■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pola1P33609 1465 aa42,69■■■■■ 4,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col14a1Q80X19 1797 aa42,69■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP42,68■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca14E9Q8F8 1683 aa42,67■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CenpjQ569L8 1344 aa42,67■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Evi5lH3BKQ3 813 aa42,67■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP42,65■■■■■ 4,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10563F6WIE4 79 aa42,6■■■■■ 4,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP42,57■■■■■ 4,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NalcnQ8BXR5 1738 aa42,57■■■■■ 4,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa42,57■■■■■ 4,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Brinp3Q499E0 766 aa42,54■■■■■ 4,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C3P01027 1663 aa42,53■■■■■ 4,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa42,52■■■■■ 4,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk19Q8BWD8 501 aa42,51■■■■■ 4,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atf3Q60765 181 aa42,48■■■■■ 4,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sirt1Q923E4 737 aa42,48■■■■■ 4,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NktrP30415 1453 aa42,48■■■■■ 4,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 InsrP15208 1372 aa42,45■■■■■ 4,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C5P06684 1680 aa42,45■■■■■ 4,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hspa1lP16627 641 aa42,44■■■■■ 4,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Als2Q920R0 1651 aa42,43■■■■■ 4,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gsto1O09131 240 aa42,42■■■■■ 4,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqsec2Q5DU25 1478 aa42,4■■■■■ 4,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcl11bQ99PV8 884 aa42,37■■■■■ 4,37
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Idi1P58044 227 aa42,32■■■■■ 4,37
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP42,32■■■■■ 4,37
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa42,32■■■■■ 4,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FanciQ8K368 1330 aa42,29■■■■■ 4,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zranb1Q7M760 708 aa42,28■■■■■ 4,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP42,27■■■■■ 4,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc10Q8R4P9 1501 aa42,24■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcna6Q61923 529 aa42,23■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem2Q5FWI3 1383 aa42,23■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP42,22■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sox12Q04890 314 aa42,21■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf316Q6PGE4 1016 aa42,21■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Idi2Q8BFZ6 227 aa42,2■■■■■ 4,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ap3b2Q9JME5 1082 aa42,19■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gimap5Q8BWF2 308 aa42,18■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc24a1Q91WD8 1130 aa42,17■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PtpruB1AUH1 1446 aa42,17■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sbno1Q689Z5 1390 aa42,17■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wnk3Q80XP9 1757 aa42,17■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhg5Q66T02 1073 aa42,16■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Farp2Q91VS8 1065 aa42,16■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cnga1P29974 684 aa42,15■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbxo41Q6NS60 873 aa42,15■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NgefQ8CHT1 710 aa42,15■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP42,14■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 KdrP35918 1367 aa42,14■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map3k19E9Q3S4 1311 aa42,14■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Camta1A2A891 1682 aa42,14■■■■■ 4,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DccP70211 1447 aa42,12■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tom1O88746 492 aa42,11■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc4a1apE9PX68 744 aa42,09■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mon2Q80TL7 1715 aa42,08■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttll13A4Q9F6 804 aa42,08■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CatipB9EKE5 520 aa42,07■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr66E9Q743 1299 aa42,07■■■■■ 4,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GnpatP98192 678 aa42,06■■■■■ 4,32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ClspnQ80YR7 1315 aa42,02■■■■■ 4,32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrl1Q80TR1 1466 aa42,01■■■■■ 4,32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PrxO55103 1391 aa42■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam184bQ0KK56 942 aa42■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif1aP33173 1695 aa42■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmf1B9EKI3 1091 aa41,98■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf335A2A5K6 1337 aa41,97■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pik3c2aQ61194 1686 aa41,96■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif24Q6NWW5 1356 aa41,96■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr17E9Q271 1322 aa41,96■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pank3Q8R2W9 370 aa41,95■■■■■ 4,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP41,92■■■■■ 4,3
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nrxn1Q9CS84 1514 aa41,85■■■■■ 4,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Inpp5dQ9ES52 1191 aa41,84■■■■■ 4,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc35g1Q8BY79 368 aa41,84■■■■■ 4,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NinlQ6ZQ12 1394 aa41,81■■■■■ 4,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fyb1O35601 819 aa41,81■■■■■ 4,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ecm2Q5FW85 670 aa41,79■■■■■ 4,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif16bB1AVY7 1312 aa41,78■■■■■ 4,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Qtrt2B8ZXI1 415 aa41,78■■■■■ 4,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zscan10Q3URR7 782 aa41,74■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP41,72■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TimelessQ9R1X4 1197 aa41,72■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa41,72■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa41,71■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp7bQ64446 1462 aa41,7■■■■■ 4,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa41,67■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa41,66■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp10bB1AWN4 1474 aa41,65■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp142G5E869 1843 aa41,65■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dcaf11Q91VU6 549 aa41,64■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Astn2Q80Z10 1352 aa41,64■■■■■ 4,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dixdc1Q80Y83 711 aa41,63■■■■■ 4,26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33,9 ms