RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Farp2Q91VS8 1065 aa28,78■■■□□ 2,2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcna6Q61923 529 aa28,77■■■□□ 2,2
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa28,76■■■□□ 2,19
Ltb-201ENSMUST00000025262 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP28,73■■■□□ 2,19
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP28,72■■■□□ 2,19
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP28,71■■■□□ 2,19
Ltb-201ENSMUST00000025262 MaddQ80U28 1577 aa28,69■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28,69■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc6D3YZP9 469 aa28,68■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acsbg1Q99PU5 721 aa28,68■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q3UJC8 639 aa28,67■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wnk3Q80XP9 1757 aa28,67■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28,67■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 InhbeO08717 350 aa28,66■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 UbtfP25976 765 aaKnown RBP28,65■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Robo1O89026 1612 aa28,64■■■□□ 2,18
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP28,63■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP28,62■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mia2Q91ZV0 1396 aa28,61■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa28,59■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stk26Q99JT2 416 aa28,59■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP28,58■■■□□ 2,17
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psrc1Q9D0P7 329 aa28,56■■■□□ 2,16
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp7bQ64446 1462 aa28,55■■■□□ 2,16
Ltb-201ENSMUST00000025262 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa28,54■■■□□ 2,16
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp32F8VPZ3 1604 aa28,54■■■□□ 2,16
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem2Q5FWI3 1383 aa28,51■■■□□ 2,16
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa28,5■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Camta1A2A891 1682 aa28,5■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp10bB1AWN4 1474 aa28,48■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sox12Q04890 314 aa28,47■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rims1Q99NE5 1463 aa28,46■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 C5P06684 1680 aa28,46■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Idi1P58044 227 aa28,46■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif1aP33173 1695 aa28,45■■■□□ 2,15
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mphosph9A6H5Y1 991 aa28,45■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cep170bQ80U49 1574 aa28,44■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP28,43■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sugp2Q8CH09 1067 aa28,43■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnks1bp1P58871 1720 aa28,43■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 PtpruB1AUH1 1446 aa28,43■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Als2Q920R0 1651 aa28,42■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cadps2Q8BYR5 1297 aa28,42■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dot1lQ6XZL8 1540 aa28,42■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28,41■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa28,4■■■□□ 2,14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP28,38■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ltbp1Q8CG19 1712 aa28,37■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Washc2Q6PGL7 1334 aa28,37■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sirt1Q923E4 737 aa28,36■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shank2Q80Z38 1476 aa28,35■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 OscarQ8VBT3 265 aa28,34■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP28,33■■■□□ 2,13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28,32■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa28,32■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc34a2Q9DBP0 697 aa28,32■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wdr17E9Q271 1322 aa28,32■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP28,31■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP28,29■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fan1Q69ZT1 1020 aa28,28■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tulp4Q9JIL5 1547 aa28,28■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abca15E9PWH4 1668 aa28,27■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubap1lG3UW59 384 aa28,27■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pkd2O35245 966 aa28,27■■■□□ 2,12
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa28,26■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 NgefQ8CHT1 710 aa28,26■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm2aP59997 1161 aa28,25■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28,25■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dixdc1Q80Y83 711 aa28,24■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP28,23■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Txnrd1Q9JMH6 613 aa28,23■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pola1P33609 1465 aa28,22■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekhg1F6S200 1446 aa28,22■■■□□ 2,11
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nfat5Q9WV30 1534 aa28,2■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP28,2■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc35g1Q8BY79 368 aa28,19■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adamts13Q769J6 1426 aa28,18■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc129Q14B48 1034 aa28,18■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ap3b2Q9JME5 1082 aa28,18■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Os9Q8K2C7 672 aa28,17■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28,17■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col16a1Q8BLX7 1580 aa28,16■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28,14■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rtl5Q5DTT4 599 aa28,14■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28,14■■■□□ 2,1
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP28,13■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr3aB2RXC6 1390 aa28,12■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa28,11■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abca14E9Q8F8 1683 aa28,1■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mink1Q9JM52 1308 aa28,1■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ly75Q60767 1723 aa28,09■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fyb1O35601 819 aa28,08■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rock1P70335 1354 aa28,08■■■□□ 2,09
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf316Q6PGE4 1016 aa28,06■■■□□ 2,08
Ltb-201ENSMUST00000025262 PaskQ8CEE6 1383 aa28,06■■■□□ 2,08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cacna1sQ02789 1880 aa28,04■■■□□ 2,08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20521D3Z5F7 333 aa28,03■■■□□ 2,08
Ltb-201ENSMUST00000025262 ZgpatQ8VDM1 511 aa28,02■■■□□ 2,08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taok3Q8BYC6 898 aa28,01■■■□□ 2,07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28,01■■■□□ 2,07
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