RNA–Protein interactions for RNA: YOR377W

ATF1, Transcript of Alcohol acetyltransferase, yeast

Gene ATF1, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATF1	YOR377W	ATR1	P13090	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	ATP15	P21306	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	VMA11	P32842	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
ATF1	YOR377W	BNS1	P50084	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	DOC1	P53068	250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	KEI1	Q06346	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	HAP3	P13434	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	HOT13	P36078	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	ANT1	Q06497	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	RAD28	Q12021	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	UBR1	P19812	1950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	SCM4	P32564	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	YAR068W	P39564	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	PAM16	P42949	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	ATG18	P43601	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	SLD7	Q08457	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	AYT1	Q12226	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	ATG5	Q12380	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATF1	YOR377W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RPB5	P20434	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YIL059C	P40520	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YGR164W	P53291	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	COA4	Q05809	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	LYS2	P07702	1392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YER134C	P40081	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	CRH1	P53301	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	FYV12	Q08559	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	UIP4	Q08926	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YFR045W	P43617	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	GAL83	Q04739	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	CDC43	P18898	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YCR050C	P25630	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	SYM1	Q06563	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RAD10	P06838	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	SRB6	P32570	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	FLO5	P38894	1075 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RPR2	P40571	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	ATG10	Q07879	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	MED11	Q99278	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	MSW1	P04803	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	PAM17	P36147	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YEL028W	P39989	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YIL152W	P40455	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	ATX2	Q12067	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	PST1	Q12355	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	MRPL44	P19956	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YER135C	P40082	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	YML122C	Q03207	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	NDD1	Q08887	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	SWC7	Q06707	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATF1	YOR377W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RAD6	P06104	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	IPT1	P38954	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YND1	P40009	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ERV14	P53173	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YCR099C	P25657	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YFL067W	P43537	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	SPG1	P50088	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	API2	Q04413	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	FIT1	Q04433	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	FEX1	Q08913	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	FEX2	Q08991	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	JID1	Q12350	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YAL064W	P39711	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	SPO73	P40031	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 98.9 ms