Protein–RNA interactions for Protein: Q12306

SMT3, Ubiquitin-like protein SMT3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMT3Q12306 NSR1YGR159C 1245 nt15.81■□□□□ 0.12
SMT3Q12306 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.38■□□□□ 0.05
SMT3Q12306 NOP1YDL014W 984 nt14.81□□□□□ -0.04
SMT3Q12306 MDJ1YFL016C 1536 nt14.46□□□□□ -0.09
SMT3Q12306 YJL027CYJL027C 417 nt13.36□□□□□ -0.27
SMT3Q12306 YKL036CYKL036C 393 nt13.11□□□□□ -0.31
SMT3Q12306 SRX1YKL086W 384 nt12.9□□□□□ -0.34
SMT3Q12306 Q0297Q0297 156 nt12.76□□□□□ -0.37
SMT3Q12306 DBP2YNL112W 1641 nt12.59□□□□□ -0.39
SMT3Q12306 YBR190WYBR190W 312 nt12.55□□□□□ -0.4
SMT3Q12306 SSA3YBL075C 1950 nt12.32□□□□□ -0.44
SMT3Q12306 RTC3YHR087W 336 nt12.2□□□□□ -0.46
SMT3Q12306 YCR051WYCR051W 669 nt12.15□□□□□ -0.46
SMT3Q12306 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.98□□□□□ -0.49
SMT3Q12306 RVS167YDR388W 1449 nt11.8□□□□□ -0.52
SMT3Q12306 CCC1YLR220W 969 nt11.78□□□□□ -0.52
SMT3Q12306 PUT4YOR348C 1884 nt11.77□□□□□ -0.53
SMT3Q12306 SCS3YGL126W 1143 nt11.61□□□□□ -0.55
SMT3Q12306 SCJ1YMR214W 1134 nt11.54□□□□□ -0.56
SMT3Q12306 RPP1BYDL130W 321 nt11.43□□□□□ -0.58
SMT3Q12306 ARE1YCR048W 1833 nt11.38□□□□□ -0.59
SMT3Q12306 YOL085CYOL085C 342 nt11.34□□□□□ -0.59
SMT3Q12306 POA1YBR022W 534 nt11.33□□□□□ -0.6
SMT3Q12306 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.25□□□□□ -0.61
SMT3Q12306 SHR5YOL110W 714 nt11.24□□□□□ -0.61
SMT3Q12306 SAH1YER043C 1350 nt11.22□□□□□ -0.61
SMT3Q12306 URN1YPR152C 1398 nt11.22□□□□□ -0.61
SMT3Q12306 BSC6YOL137W 1494 nt11.21□□□□□ -0.61
SMT3Q12306 OPI9YLR338W 858 nt11.2□□□□□ -0.62
SMT3Q12306 PKP1YIL042C 1185 nt11.18□□□□□ -0.62
SMT3Q12306 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.13□□□□□ -0.63
SMT3Q12306 SPT5YML010W 3192 nt11.1□□□□□ -0.63
SMT3Q12306 RPN10YHR200W 807 nt11.01□□□□□ -0.65
SMT3Q12306 DEP1YAL013W 1218 nt11□□□□□ -0.65
SMT3Q12306 SSA4YER103W 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
SMT3Q12306 PET122YER153C 765 nt10.94□□□□□ -0.66
SMT3Q12306 BUD23YCR047C 828 nt10.92□□□□□ -0.66
SMT3Q12306 PUN1YLR414C 792 nt10.9□□□□□ -0.66
SMT3Q12306 YNL208WYNL208W 600 nt10.87□□□□□ -0.67
SMT3Q12306 YDJ1YNL064C 1230 nt10.82□□□□□ -0.68
SMT3Q12306 PTC2YER089C 1395 nt10.8□□□□□ -0.68
SMT3Q12306 NAB2YGL122C 1578 nt10.77□□□□□ -0.68
SMT3Q12306 SCR1SCR1 522 nt10.75□□□□□ -0.69
SMT3Q12306 YJR018WYJR018W 363 nt10.68□□□□□ -0.7
SMT3Q12306 BDF1YLR399C 2061 nt10.61□□□□□ -0.71
SMT3Q12306 MEP2YNL142W 1500 nt10.6□□□□□ -0.71
SMT3Q12306 GAR1YHR089C 618 nt10.59□□□□□ -0.71
SMT3Q12306 RRN5YLR141W 1092 nt10.57□□□□□ -0.72
SMT3Q12306 FIS1YIL065C 468 nt10.55□□□□□ -0.72
SMT3Q12306 DAL1YIR027C 1383 nt10.52□□□□□ -0.72
SMT3Q12306 TAT1YBR069C 1860 nt10.48□□□□□ -0.73
SMT3Q12306 FPR4YLR449W 1179 nt10.42□□□□□ -0.74
SMT3Q12306 INM2YDR287W 879 nt10.41□□□□□ -0.74
SMT3Q12306 PHO4YFR034C 939 nt10.41□□□□□ -0.74
SMT3Q12306 YPS1YLR120C 1710 nt10.41□□□□□ -0.74
SMT3Q12306 RPP2BYDR382W 333 nt10.36□□□□□ -0.75
SMT3Q12306 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.36□□□□□ -0.75
SMT3Q12306 YJR120WYJR120W 351 nt10.36□□□□□ -0.75
SMT3Q12306 DCW1YKL046C 1350 nt10.36□□□□□ -0.75
SMT3Q12306 YJL225CYJL225C 5277 nt10.34□□□□□ -0.75
SMT3Q12306 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.31□□□□□ -0.76
SMT3Q12306 YMR090WYMR090W 684 nt10.3□□□□□ -0.76
SMT3Q12306 TIR1YER011W 765 nt10.29□□□□□ -0.76
SMT3Q12306 YDR095CYDR095C 411 nt10.27□□□□□ -0.77
SMT3Q12306 EMI2YDR516C 1503 nt10.26□□□□□ -0.77
SMT3Q12306 YBR220CYBR220C 1683 nt10.25□□□□□ -0.77
SMT3Q12306 ATS1YAL020C 1002 nt10.24□□□□□ -0.77
SMT3Q12306 SSA1YAL005C 1929 nt10.24□□□□□ -0.77
SMT3Q12306 YBL100CYBL100C 315 nt10.2□□□□□ -0.78
SMT3Q12306 RSB1YOR049C 1065 nt10.2□□□□□ -0.78
SMT3Q12306 PAC11YDR488C 1602 nt10.17□□□□□ -0.78
SMT3Q12306 YDL221WYDL221W 552 nt10.16□□□□□ -0.78
SMT3Q12306 SDH1YKL148C 1923 nt10.13□□□□□ -0.79
SMT3Q12306 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.08□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 RPP2AYOL039W 321 nt10.08□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 FUN26YAL022C 1554 nt10.05□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 PTP1YDL230W 1008 nt10.04□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 SEC11YIR022W 504 nt10.04□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 BDH2YAL061W 1254 nt10.04□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 ALF1YNL148C 765 nt10.04□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 CAC2YML102W 1407 nt10.03□□□□□ -0.8
SMT3Q12306 PCH2YBR186W 1695 nt10.02□□□□□ -0.81
SMT3Q12306 SCC4YER147C 1875 nt9.98□□□□□ -0.81
SMT3Q12306 GUT2YIL155C 1950 nt9.97□□□□□ -0.81
SMT3Q12306 TRM9YML014W 840 nt9.94□□□□□ -0.82
SMT3Q12306 SRB2YHR041C 633 nt9.91□□□□□ -0.82
SMT3Q12306 IRC15YPL017C 1500 nt9.91□□□□□ -0.82
SMT3Q12306 SIS1YNL007C 1059 nt9.89□□□□□ -0.83
SMT3Q12306 CCT6YDR188W 1641 nt9.89□□□□□ -0.83
SMT3Q12306 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.88□□□□□ -0.83
SMT3Q12306 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.88□□□□□ -0.83
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